RNA id: TCONS_00046073


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00046073
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_023292
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 7967484 ~ 7967600 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ggccacagccatatcaccctgcagcccgagattggttactcactgaagataAGCAGGGCTGTGTCTGGTCAGTACATGGATGGGAGAACACATGgcaaaactaggttgctgttggca

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000188226

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00046062 lncRNA downstream 389724 7573810 ~ 7577760 (-) True XLOC_023285
TCONS_00047151 lncRNA downstream 1320220 6607112 ~ 6647264 (-) False XLOC_023279
TCONS_00046050 lncRNA downstream 1320285 6644430 ~ 6647199 (-) True XLOC_023279
TCONS_00046039 lncRNA downstream 1624587 6291593 ~ 6342897 (-) False XLOC_023276
TCONS_00047150 lncRNA downstream 1866364 6088272 ~ 6101120 (-) True XLOC_023272
TCONS_00047152 lncRNA upstream 1285134 9252734 ~ 9286642 (-) False XLOC_023304
TCONS_00046093 lncRNA upstream 1302349 9269949 ~ 9286635 (-) False XLOC_023304
TCONS_00047153 lncRNA upstream 1302351 9269951 ~ 9286635 (-) False XLOC_023304
TCONS_00047154 lncRNA upstream 1302351 9269951 ~ 9286636 (-) True XLOC_023304
TCONS_00047155 lncRNA upstream 1307495 9275095 ~ 9281017 (-) True XLOC_023305
TCONS_00046072 mRNA downstream 9903 7941373 ~ 7957581 (-) True XLOC_023291
TCONS_00046071 mRNA downstream 140995 7820042 ~ 7826489 (-) True XLOC_023290
TCONS_00046068 mRNA downstream 190095 7748751 ~ 7777389 (-) False XLOC_023289
TCONS_00046070 mRNA downstream 198669 7748952 ~ 7768815 (-) False XLOC_023289
TCONS_00046069 mRNA downstream 198669 7748952 ~ 7768815 (-) True XLOC_023289
TCONS_00046074 mRNA upstream 20858 7988458 ~ 7995960 (-) True XLOC_023293
TCONS_00046075 mRNA upstream 166126 8133726 ~ 8214253 (-) True XLOC_023294
TCONS_00046076 mRNA upstream 276485 8244085 ~ 8261786 (-) True XLOC_023295
TCONS_00046077 mRNA upstream 425690 8393290 ~ 8412526 (-) False XLOC_023296
TCONS_00046078 mRNA upstream 425698 8393298 ~ 8409708 (-) False XLOC_023296
TCONS_00046064 other downstream 342718 7619376 ~ 7624766 (-) True XLOC_023286
TCONS_00046061 other downstream 399158 7563361 ~ 7568326 (-) False XLOC_023285
TCONS_00046060 other downstream 402638 7563361 ~ 7564846 (-) False XLOC_023285
TCONS_00046055 other downstream 1195107 6771308 ~ 6772377 (-) True XLOC_023283
TCONS_00046038 other downstream 1624587 6291593 ~ 6342897 (-) False XLOC_023276
TCONS_00046092 other upstream 1137013 9104613 ~ 9126025 (-) True XLOC_023303
TCONS_00046097 other upstream 1599199 9566799 ~ 9612356 (-) True XLOC_023307
TCONS_00046100 other upstream 1744895 9712495 ~ 9712610 (-) True XLOC_023309
TCONS_00046104 other upstream 1930462 9898062 ~ 9949362 (-) True XLOC_023311
TCONS_00046122 other upstream 2288314 10255914 ~ 10256030 (-) True XLOC_023317