RNA id: TCONS_00047595


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00047595
length 286
RNA type misc_RNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_023973
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 15217824 ~ 15218109 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CTGTGATCTCAGAAGGTCAGGAAAACCGCTGGATCTGCATCACATTACACTGCCACTTTCGTACACGAAGGCCATCCCTTATCCAATTAACTGAGATCCGTCTTTATTTGTCAAACATTTAGGCCTCAGCGTAGCCGGAAGTGTTGGCCGAGGAGCAGGACGTGGCTAAGCAGAGGCAGCTCTCATTAAATTGATGAGCTGAGATCTGGTCCTACTTCACCATCTGGAATTGTAGTCTGGGGTTCTGCTGAAAGCTGCTGACCCAGGATTCAACTCTTCAACTCGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000166149

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049032 lncRNA upstream 91520 15100538 ~ 15126304 (+) True XLOC_023970
TCONS_00049209 lncRNA upstream 183240 14934372 ~ 15034584 (+) False XLOC_023969
TCONS_00049031 lncRNA upstream 266562 14934317 ~ 14951262 (+) False XLOC_023969
TCONS_00049208 lncRNA upstream 266652 14934372 ~ 14951172 (+) False XLOC_023969
TCONS_00049030 lncRNA upstream 283108 14934317 ~ 14934716 (+) False XLOC_023969
TCONS_00049033 lncRNA downstream 266164 15484273 ~ 15486780 (+) True XLOC_023977
TCONS_00049034 lncRNA downstream 322657 15540766 ~ 15609995 (+) True XLOC_023980
TCONS_00049210 lncRNA downstream 848768 16066877 ~ 16075263 (+) False XLOC_023985
TCONS_00049211 lncRNA downstream 848768 16066877 ~ 16075816 (+) False XLOC_023985
TCONS_00049212 lncRNA downstream 851720 16069829 ~ 16075101 (+) False XLOC_023985
TCONS_00047590 mRNA upstream 318715 14870043 ~ 14899109 (+) False XLOC_023968
TCONS_00047591 mRNA upstream 319410 14870077 ~ 14898414 (+) True XLOC_023968
TCONS_00047589 mRNA upstream 478542 14697247 ~ 14739282 (+) True XLOC_023967
TCONS_00047587 mRNA upstream 478766 14694876 ~ 14739058 (+) False XLOC_023967
TCONS_00047588 mRNA upstream 479399 14694914 ~ 14738425 (+) False XLOC_023967
TCONS_00047596 mRNA downstream 55261 15273370 ~ 15285590 (+) True XLOC_023974
TCONS_00047597 mRNA downstream 68927 15287036 ~ 15351444 (+) True XLOC_023975
TCONS_00047598 mRNA downstream 135986 15354095 ~ 15482419 (+) True XLOC_023976
TCONS_00047601 mRNA downstream 429641 15647750 ~ 15800834 (+) False XLOC_023981
TCONS_00047602 mRNA downstream 429884 15647993 ~ 15800831 (+) False XLOC_023981
TCONS_00047594 other upstream 83106 15134602 ~ 15134718 (+) True XLOC_023972
TCONS_00047593 other upstream 98094 15119597 ~ 15119730 (+) True XLOC_023971
TCONS_00047592 other upstream 276922 14940788 ~ 14940902 (+) True XLOC_023969
TCONS_00047586 other upstream 533477 14684233 ~ 14684347 (+) True XLOC_023966
TCONS_00047580 other upstream 1083120 14134590 ~ 14134704 (+) True XLOC_023961
TCONS_00047599 other downstream 269385 15487494 ~ 15489644 (+) True XLOC_023978
TCONS_00047600 other downstream 272103 15490212 ~ 15490667 (+) True XLOC_023979
TCONS_00047619 other downstream 968235 16186344 ~ 16188838 (+) False XLOC_023988
TCONS_00047637 other downstream 1553682 16771791 ~ 16771908 (+) True XLOC_023997
TCONS_00047645 other downstream 2026464 17244573 ~ 17270566 (+) False XLOC_024003