RNA id: TCONS_00049661



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00049661
length 88
RNA type miRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_025131
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 13406451 ~ 13413213 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGTTGTGTGGTGTCAGGACTTAACCCACTTGTGAACAATGCATCGAACTTCAATGTTCACAGTGGTTAAGTTCTGCCGCCCCTAGACC

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116792

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00052618 lncRNA upstream 369 13389944 ~ 13406082 (+) True XLOC_025129
TCONS_00052328 lncRNA upstream 15613 13389862 ~ 13390838 (+) False XLOC_025129
TCONS_00052617 lncRNA upstream 38943 13360703 ~ 13367508 (+) True XLOC_025128
TCONS_00049655 lncRNA upstream 239123 13149550 ~ 13167328 (+) True XLOC_025125
TCONS_00052616 lncRNA upstream 563521 12839025 ~ 12842930 (+) True XLOC_025122
TCONS_00052620 lncRNA downstream 70334 13476872 ~ 13477873 (+) True XLOC_025134
TCONS_00052621 lncRNA downstream 621705 14028243 ~ 14073770 (+) True XLOC_025145
TCONS_00052329 lncRNA downstream 794505 14201043 ~ 14202519 (+) True XLOC_025147
TCONS_00049683 lncRNA downstream 835581 14242119 ~ 14248150 (+) False XLOC_025148
TCONS_00052330 lncRNA downstream 837660 14244198 ~ 14248538 (+) False XLOC_025148
TCONS_00049659 mRNA upstream 59355 13332870 ~ 13347096 (+) True XLOC_025127
TCONS_00049657 mRNA upstream 147553 13190028 ~ 13258898 (+) False XLOC_025126
TCONS_00049658 mRNA upstream 147553 13242690 ~ 13258898 (+) True XLOC_025126
TCONS_00049656 mRNA upstream 148348 13190012 ~ 13258103 (+) False XLOC_025126
TCONS_00049654 mRNA upstream 543971 12861158 ~ 12862480 (+) True XLOC_025124
TCONS_00049662 mRNA downstream 34362 13440900 ~ 13446085 (+) True XLOC_025132
TCONS_00049663 mRNA downstream 63166 13469704 ~ 13473197 (+) True XLOC_025133
TCONS_00049664 mRNA downstream 76004 13482542 ~ 13489945 (+) True XLOC_025135
TCONS_00049665 mRNA downstream 105446 13511984 ~ 13521115 (+) True XLOC_025136
TCONS_00049666 mRNA downstream 152661 13559199 ~ 13567762 (+) True XLOC_025137
TCONS_00049660 other upstream 128 13406226 ~ 13406323 (+) True XLOC_025130
TCONS_00049628 other upstream 1459494 11943549 ~ 11946957 (+) True XLOC_025104
TCONS_00049621 other upstream 3242890 10152138 ~ 10163561 (+) True XLOC_025087
TCONS_00049609 other upstream 4364356 9041989 ~ 9042095 (+) True XLOC_025081
TCONS_00049608 other upstream 4364883 9041462 ~ 9041568 (+) True XLOC_025080
TCONS_00049675 other downstream 441688 13848226 ~ 13857716 (+) False XLOC_025143
TCONS_00049684 other downstream 838128 14244666 ~ 14244784 (+) True XLOC_025148
TCONS_00049690 other downstream 992687 14399225 ~ 14399652 (+) True XLOC_025154
TCONS_00049704 other downstream 1268231 14674769 ~ 14684603 (+) True XLOC_025161
TCONS_00049719 other downstream 2284765 15691303 ~ 15719823 (+) True XLOC_025174