RNA id: TCONS_00049684


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00049684
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_025148
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 14242119 ~ 14248538 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCTGCCCTTCATCTCACAGCTCAGGTAAGACAATCTACTGCAACATCattaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacacggGTAAAAACAAGGTTaatgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000124695

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00052329 lncRNA upstream 42147 14201043 ~ 14202519 (+) True XLOC_025147
TCONS_00052621 lncRNA upstream 170896 14028243 ~ 14073770 (+) True XLOC_025145
TCONS_00052620 lncRNA upstream 766793 13476872 ~ 13477873 (+) True XLOC_025134
TCONS_00052619 lncRNA upstream 831453 13406537 ~ 13413213 (+) True XLOC_025131
TCONS_00052618 lncRNA upstream 838584 13389944 ~ 13406082 (+) True XLOC_025129
TCONS_00052331 lncRNA downstream 6460 14251244 ~ 14254765 (+) True XLOC_025149
TCONS_00052622 lncRNA downstream 32866 14277650 ~ 14287841 (+) True XLOC_025151
TCONS_00052623 lncRNA downstream 985168 15229952 ~ 15231838 (+) True XLOC_025164
TCONS_00052624 lncRNA downstream 1027162 15271946 ~ 15272293 (+) False XLOC_025165
TCONS_00049715 lncRNA downstream 1260400 15505184 ~ 15506157 (+) False XLOC_025169
TCONS_00049682 mRNA upstream 55644 14157090 ~ 14189022 (+) True XLOC_025146
TCONS_00049681 mRNA upstream 308829 13929860 ~ 13935837 (+) True XLOC_025144
TCONS_00049680 mRNA upstream 343592 13879446 ~ 13901074 (+) True XLOC_025143
TCONS_00049676 mRNA upstream 365031 13848226 ~ 13879635 (+) False XLOC_025143
TCONS_00049673 mRNA upstream 366962 13842554 ~ 13877704 (+) False XLOC_025143
TCONS_00049685 mRNA downstream 14331 14259115 ~ 14260797 (+) True XLOC_025150
TCONS_00049686 mRNA downstream 73018 14317802 ~ 14373164 (+) False XLOC_025152
TCONS_00049687 mRNA downstream 94944 14339728 ~ 14373165 (+) True XLOC_025152
TCONS_00049688 mRNA downstream 143226 14388010 ~ 14452323 (+) False XLOC_025153
TCONS_00049689 mRNA downstream 143226 14388010 ~ 14452325 (+) True XLOC_025153
TCONS_00049675 other upstream 386950 13848226 ~ 13857716 (+) False XLOC_025143
TCONS_00049661 other upstream 838128 13406451 ~ 13406538 (+) False XLOC_025131
TCONS_00049660 other upstream 838343 13406226 ~ 13406323 (+) True XLOC_025130
TCONS_00049628 other upstream 2297709 11943549 ~ 11946957 (+) True XLOC_025104
TCONS_00049621 other upstream 4081105 10152138 ~ 10163561 (+) True XLOC_025087
TCONS_00049690 other downstream 154441 14399225 ~ 14399652 (+) True XLOC_025154
TCONS_00049704 other downstream 429985 14674769 ~ 14684603 (+) True XLOC_025161
TCONS_00049719 other downstream 1446519 15691303 ~ 15719823 (+) True XLOC_025174
TCONS_00049721 other downstream 1510939 15755723 ~ 15774178 (+) False XLOC_025176
TCONS_00049736 other downstream 2128228 16373012 ~ 16373127 (+) True XLOC_025188