RNA id: TCONS_00049721



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00049721
length 447
RNA type processed_transcript
GC content 0.49
exon number 2
gene id XLOC_025176
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 15755723 ~ 15795396 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GATATGCGAGACTCAAGCCATCAGACACGTAGCGATGGCTTGTAAAGCAAAACACCGCTGGATTCCAGCAGCAGAACATTTAAGATAGTCAGTGTGCGCGTGCACGCGAACGCGCGCTGCTTGCCAAAAAACTCACAGCGCTCGCTGAGAAAGAGTTTGTCTGaaactagtgtttttttttgttttcttctgaaGATTTGTGTTTCATCCGACACAACTTGAGGCTCGCGGTATGAGGGAGAGGGCGCTCGTGTCTCGGGTAGCGTCTAGCTGCGGGGTGCTAATTCGGAGCAGTTGGTGATGACTGCAAGATCTAAGCGTTGAGTTGAACAGCAAAGAGACGCCATCACATcacagagaaagagaggaggCGGCTTTTTGTGTCTGAATCAGCAGAGATTGCAGATGAGGCGCCGCTATTGTTTCTCCAAGTGAAATGGAGATGCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000140160

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00052627 lncRNA upstream 63136 15685362 ~ 15692587 (+) False XLOC_025174
TCONS_00052628 lncRNA upstream 63136 15685494 ~ 15692587 (+) False XLOC_025174
TCONS_00052629 lncRNA upstream 63136 15685755 ~ 15692587 (+) False XLOC_025174
TCONS_00052626 lncRNA upstream 109056 15639452 ~ 15646667 (+) True XLOC_025173
TCONS_00052625 lncRNA upstream 133969 15618278 ~ 15621754 (+) True XLOC_025172
TCONS_00052333 lncRNA downstream 91743 15865921 ~ 15866402 (+) True XLOC_025180
TCONS_00049732 lncRNA downstream 280831 16055009 ~ 16055732 (+) True XLOC_025183
TCONS_00052630 lncRNA downstream 379046 16153224 ~ 16161459 (+) True XLOC_025184
TCONS_00052631 lncRNA downstream 412415 16186593 ~ 16241340 (+) True XLOC_025185
TCONS_00049734 lncRNA downstream 455749 16229927 ~ 16232282 (+) True XLOC_025186
TCONS_00049720 mRNA upstream 8724 15736811 ~ 15746999 (+) True XLOC_025175
TCONS_00049717 mRNA upstream 147557 15550522 ~ 15608166 (+) False XLOC_025171
TCONS_00049718 mRNA upstream 147690 15550544 ~ 15608033 (+) True XLOC_025171
TCONS_00049714 mRNA upstream 330034 15394428 ~ 15425689 (+) True XLOC_025168
TCONS_00049711 mRNA upstream 363257 15358459 ~ 15392466 (+) False XLOC_025167
TCONS_00049723 mRNA downstream 2268 15776446 ~ 15795110 (+) True XLOC_025176
TCONS_00049724 mRNA downstream 31739 15805917 ~ 15811037 (+) False XLOC_025177
TCONS_00049725 mRNA downstream 34920 15809098 ~ 15809943 (+) True XLOC_025177
TCONS_00049726 mRNA downstream 43466 15817644 ~ 15824100 (+) True XLOC_025178
TCONS_00049727 mRNA downstream 54248 15828426 ~ 15835907 (+) False XLOC_025179
TCONS_00049719 other upstream 35900 15691303 ~ 15719823 (+) True XLOC_025174
TCONS_00049704 other upstream 1071120 14674769 ~ 14684603 (+) True XLOC_025161
TCONS_00049690 other upstream 1356071 14399225 ~ 14399652 (+) True XLOC_025154
TCONS_00049684 other upstream 1510939 14244666 ~ 14244784 (+) True XLOC_025148
TCONS_00049675 other upstream 1898007 13848226 ~ 13857716 (+) False XLOC_025143
TCONS_00049736 other downstream 598834 16373012 ~ 16373127 (+) True XLOC_025188
TCONS_00049741 other downstream 795087 16569265 ~ 16588629 (+) True XLOC_025190
TCONS_00049746 other downstream 894425 16668603 ~ 16678650 (+) False XLOC_025192
TCONS_00049749 other downstream 950436 16724614 ~ 16729015 (+) False XLOC_025193
TCONS_00049766 other downstream 1621061 17395239 ~ 17461885 (+) True XLOC_025203

Expression Profile


//