RNA id: TCONS_00053920



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00053920
length 82
RNA type miRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_027423
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 28708430 ~ 28708511 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTCACTATCGGTACCCTCACAAAGGCACTGACTTGGATGCTGTAATTGGTAAGTGCTATTTGTTGGGGTAGTTTCAAGTGAC

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000188851

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057738 lncRNA upstream 72886 28633247 ~ 28635544 (+) True XLOC_027378
TCONS_00053863 lncRNA upstream 336992 28364263 ~ 28371438 (+) True XLOC_027373
TCONS_00053854 lncRNA upstream 1599643 27100554 ~ 27108787 (+) True XLOC_027369
TCONS_00057737 lncRNA upstream 1871755 26831255 ~ 26836675 (+) True XLOC_027366
TCONS_00053841 lncRNA upstream 2135774 26496503 ~ 26572656 (+) False XLOC_027364
TCONS_00057740 lncRNA downstream 254263 28962774 ~ 28963359 (+) False XLOC_027430
TCONS_00057154 lncRNA downstream 378502 29087013 ~ 29088974 (+) True XLOC_027432
TCONS_00057155 lncRNA downstream 445841 29154352 ~ 29155020 (+) True XLOC_027433
TCONS_00057741 lncRNA downstream 463929 29172440 ~ 29281146 (+) True XLOC_027435
TCONS_00057742 lncRNA downstream 497354 29205865 ~ 29207036 (+) False XLOC_027436
TCONS_00053869 mRNA upstream 203914 28473223 ~ 28504516 (+) False XLOC_027377
TCONS_00053871 mRNA upstream 208461 28495882 ~ 28499969 (+) False XLOC_027377
TCONS_00053870 mRNA upstream 208461 28495882 ~ 28499969 (+) True XLOC_027377
TCONS_00053867 mRNA upstream 258490 28442223 ~ 28449940 (+) False XLOC_027377
TCONS_00053866 mRNA upstream 284237 28418829 ~ 28424193 (+) True XLOC_027376
TCONS_00053926 mRNA downstream 106339 28814850 ~ 28822393 (+) True XLOC_027429
TCONS_00053927 mRNA downstream 254263 28962774 ~ 28976560 (+) True XLOC_027430
TCONS_00053928 mRNA downstream 289084 28997595 ~ 29000569 (+) False XLOC_027431
TCONS_00053929 mRNA downstream 289719 28998230 ~ 29000256 (+) True XLOC_027431
TCONS_00053930 mRNA downstream 457329 29165840 ~ 29290030 (+) True XLOC_027434
TCONS_00053919 other upstream 650 28707700 ~ 28707780 (+) True XLOC_027422
TCONS_00053918 other upstream 901 28707457 ~ 28707529 (+) True XLOC_027421
TCONS_00053917 other upstream 1033 28707316 ~ 28707397 (+) True XLOC_027420
TCONS_00053916 other upstream 1240 28707110 ~ 28707190 (+) True XLOC_027419
TCONS_00053915 other upstream 1505 28706853 ~ 28706925 (+) True XLOC_027418
TCONS_00053921 other downstream 82 28708593 ~ 28708665 (+) True XLOC_027424
TCONS_00053922 other downstream 339 28708850 ~ 28708930 (+) True XLOC_027425
TCONS_00053923 other downstream 545 28709056 ~ 28709137 (+) True XLOC_027426
TCONS_00053924 other downstream 686 28709197 ~ 28709269 (+) True XLOC_027427
TCONS_00053925 other downstream 943 28709454 ~ 28709534 (+) True XLOC_027428