RNA id: TCONS_00053924



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00053924
length 73
RNA type miRNA
GC content 0.34
exon number 1
gene id XLOC_027427
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 28709197 ~ 28709269 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATTAAGATCACTTCAAACAGGAGCATTGATTTGTCCTTTGTTCATAAGTGCTTCTCTTTGGGGTAGTTTTAAT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181020

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057738 lncRNA upstream 73653 28633247 ~ 28635544 (+) True XLOC_027378
TCONS_00053863 lncRNA upstream 337759 28364263 ~ 28371438 (+) True XLOC_027373
TCONS_00053854 lncRNA upstream 1600410 27100554 ~ 27108787 (+) True XLOC_027369
TCONS_00057737 lncRNA upstream 1872522 26831255 ~ 26836675 (+) True XLOC_027366
TCONS_00053841 lncRNA upstream 2136541 26496503 ~ 26572656 (+) False XLOC_027364
TCONS_00057740 lncRNA downstream 253505 28962774 ~ 28963359 (+) False XLOC_027430
TCONS_00057154 lncRNA downstream 377744 29087013 ~ 29088974 (+) True XLOC_027432
TCONS_00057155 lncRNA downstream 445083 29154352 ~ 29155020 (+) True XLOC_027433
TCONS_00057741 lncRNA downstream 463171 29172440 ~ 29281146 (+) True XLOC_027435
TCONS_00057742 lncRNA downstream 496596 29205865 ~ 29207036 (+) False XLOC_027436
TCONS_00053869 mRNA upstream 204681 28473223 ~ 28504516 (+) False XLOC_027377
TCONS_00053871 mRNA upstream 209228 28495882 ~ 28499969 (+) False XLOC_027377
TCONS_00053870 mRNA upstream 209228 28495882 ~ 28499969 (+) True XLOC_027377
TCONS_00053867 mRNA upstream 259257 28442223 ~ 28449940 (+) False XLOC_027377
TCONS_00053866 mRNA upstream 285004 28418829 ~ 28424193 (+) True XLOC_027376
TCONS_00053926 mRNA downstream 105581 28814850 ~ 28822393 (+) True XLOC_027429
TCONS_00053927 mRNA downstream 253505 28962774 ~ 28976560 (+) True XLOC_027430
TCONS_00053928 mRNA downstream 288326 28997595 ~ 29000569 (+) False XLOC_027431
TCONS_00053929 mRNA downstream 288961 28998230 ~ 29000256 (+) True XLOC_027431
TCONS_00053930 mRNA downstream 456571 29165840 ~ 29290030 (+) True XLOC_027434
TCONS_00053923 other upstream 60 28709056 ~ 28709137 (+) True XLOC_027426
TCONS_00053922 other upstream 267 28708850 ~ 28708930 (+) True XLOC_027425
TCONS_00053921 other upstream 532 28708593 ~ 28708665 (+) True XLOC_027424
TCONS_00053920 other upstream 686 28708430 ~ 28708511 (+) True XLOC_027423
TCONS_00053919 other upstream 1417 28707700 ~ 28707780 (+) True XLOC_027422
TCONS_00053925 other downstream 185 28709454 ~ 28709534 (+) True XLOC_027428
TCONS_00053941 other downstream 1547722 30256991 ~ 30260836 (+) True XLOC_027449
TCONS_00053946 other downstream 1936697 30645966 ~ 30646791 (+) True XLOC_027455
TCONS_00053952 other downstream 2194712 30903981 ~ 30904129 (+) True XLOC_027459
TCONS_00053953 other downstream 2196003 30905272 ~ 30905435 (+) True XLOC_027460