RNA id: TCONS_00064112


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064112
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_032997
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 37447028 ~ 37447143 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACccacagccatatcactctgcagcccaagaccggttactcactgaagctaagcagttgTTAGGGTTAGGGTCAGTACATTGGAGATCAcgtgggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178620

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065195 lncRNA downstream 102434 37342328 ~ 37344594 (-) True XLOC_032992
TCONS_00065194 lncRNA downstream 818931 36621310 ~ 36628097 (-) True XLOC_032987
TCONS_00064099 lncRNA downstream 894281 36551736 ~ 36552747 (-) True XLOC_032986
TCONS_00065193 lncRNA downstream 1053533 36386292 ~ 36393495 (-) True XLOC_032984
TCONS_00065192 lncRNA downstream 1157154 36287886 ~ 36289874 (-) True XLOC_032983
TCONS_00064129 lncRNA upstream 301412 37748555 ~ 37749697 (-) True XLOC_033005
TCONS_00065196 lncRNA upstream 685368 38132511 ~ 38358080 (-) False XLOC_033006
TCONS_00065197 lncRNA upstream 1312403 38759546 ~ 38763847 (-) False XLOC_033009
TCONS_00065198 lncRNA upstream 1312403 38759546 ~ 38764324 (-) False XLOC_033009
TCONS_00065199 lncRNA upstream 1312403 38759546 ~ 38764326 (-) False XLOC_033009
TCONS_00064110 mRNA downstream 5508 37431169 ~ 37441520 (-) True XLOC_032995
TCONS_00064109 mRNA downstream 24187 37409558 ~ 37422841 (-) True XLOC_032994
TCONS_00064108 mRNA downstream 43584 37389683 ~ 37403444 (-) True XLOC_032993
TCONS_00064100 mRNA downstream 651809 36717985 ~ 36795219 (-) False XLOC_032988
TCONS_00064113 mRNA upstream 4198 37451341 ~ 37460178 (-) False XLOC_032998
TCONS_00064114 mRNA upstream 6537 37453680 ~ 37459759 (-) True XLOC_032998
TCONS_00064115 mRNA upstream 13126 37460269 ~ 37469775 (-) False XLOC_032999
TCONS_00064116 mRNA upstream 14333 37461476 ~ 37468971 (-) True XLOC_032999
TCONS_00064117 mRNA upstream 31622 37478765 ~ 37513133 (-) False XLOC_033000
TCONS_00064111 other downstream 7658 37439255 ~ 37439370 (-) True XLOC_032996
TCONS_00064106 other downstream 676959 36769939 ~ 36770069 (-) True XLOC_032991
TCONS_00064105 other downstream 702777 36744134 ~ 36744251 (-) True XLOC_032990
TCONS_00064104 other downstream 713202 36733709 ~ 36733826 (-) True XLOC_032989
TCONS_00064097 other downstream 944698 36479193 ~ 36502330 (-) True XLOC_032985
TCONS_00064119 other upstream 51003 37498146 ~ 37498856 (-) True XLOC_033000
TCONS_00064123 other upstream 168223 37615366 ~ 37615483 (-) True XLOC_033003
TCONS_00064130 other upstream 685368 38132511 ~ 38357713 (-) False XLOC_033006
TCONS_00064131 other upstream 908619 38355762 ~ 38358080 (-) True XLOC_033006
TCONS_00064134 other upstream 919953 38367096 ~ 38426942 (-) True XLOC_033007

Expression Profile

//