RNA id: TCONS_00065434



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00065434
length 507
RNA type mRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_033410
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 5908077 ~ 5908583 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CAACGGAGTTATACGTTGTTTCTTGAGAACTAACTGTGCATCATGAGCGGAAGAGGCAAAACCGGCGGTAAGGCCCGAGCAAAGGCTAAGACTCGCTCCTCTAGGGCGGGCCTGCAGTTCCCCGTTGGTCGCGTTCACAGACTGCTCCGCAAGGGTAACTACGCTCAGCGGGTTGGTGCTGGAGCTCCAGTGTATCTGGCCGCTGTGCTCGAGTATTTGACTGCTGAGATCCTGGAATTGGCTGGAAACGCTGCCCGGGACAACAAGAAGACCCGCATCATCCCCCGACATCTGCAGCTGGCGGTGCGTAATGATGAGGAGCTGAACAAGCTTCTGGGTGGAGTGACCATCGCTCAGGGCGGTGTGCTGCCCAACATCCAGGCCGTGCTGCTGCCCAAGAAGACAGAGAAGGCCGCCAAAGGCAAATAAACTGAAGTTGCAATTTTAAACCTACCCAAAGGCTCTTATCAGAGCCACCCACTTTCTCTATAAATGGCAATTTTGTTA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000173404

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068547 lncRNA upstream 80577 5826581 ~ 5827500 (+) True XLOC_033406
TCONS_00068544 lncRNA upstream 89701 5814145 ~ 5818376 (+) False XLOC_033405
TCONS_00068548 lncRNA downstream 35227 5943810 ~ 5947127 (+) True XLOC_033416
TCONS_00068770 lncRNA downstream 70075 5978658 ~ 6243430 (+) True XLOC_033427
TCONS_00068549 lncRNA downstream 145262 6053845 ~ 6057362 (+) True XLOC_033428
TCONS_00068550 lncRNA downstream 340809 6249392 ~ 6252661 (+) True XLOC_033429
TCONS_00068771 lncRNA downstream 1357099 7265682 ~ 7275388 (+) True XLOC_033443
TCONS_00065433 mRNA upstream 1082 5906327 ~ 5906995 (+) True XLOC_033409
TCONS_00065432 mRNA upstream 2337 5905091 ~ 5905740 (+) True XLOC_033408
TCONS_00065431 mRNA upstream 3479 5904020 ~ 5904598 (+) True XLOC_033407
TCONS_00065427 mRNA upstream 335831 5566582 ~ 5572246 (+) False XLOC_033402
TCONS_00065423 mRNA upstream 358773 5530154 ~ 5549304 (+) False XLOC_033399
TCONS_00065435 mRNA downstream 688 5909271 ~ 5909676 (+) True XLOC_033411
TCONS_00065436 mRNA downstream 1884 5910467 ~ 5910989 (+) True XLOC_033412
TCONS_00065437 mRNA downstream 3087 5911670 ~ 5912374 (+) True XLOC_033413
TCONS_00065438 mRNA downstream 4447 5913030 ~ 5913529 (+) True XLOC_033414
TCONS_00065439 mRNA downstream 12082 5920665 ~ 5942776 (+) False XLOC_033415
TCONS_00065428 other upstream 337883 5569548 ~ 5570194 (+) False XLOC_033402
TCONS_00065420 other upstream 718181 5189778 ~ 5189896 (+) True XLOC_033396
TCONS_00065416 other upstream 908806 4998793 ~ 4999271 (+) True XLOC_033393
TCONS_00065411 other upstream 941740 4966092 ~ 4966337 (+) True XLOC_033390
TCONS_00065402 other upstream 1026390 4880423 ~ 4881687 (+) False XLOC_033375
TCONS_00065457 other downstream 789390 6697973 ~ 6698091 (+) True XLOC_033435
TCONS_00065458 other downstream 847623 6756206 ~ 6800689 (+) False XLOC_033436
TCONS_00065469 other downstream 1139673 7048256 ~ 7093901 (+) True XLOC_033440
TCONS_00065483 other downstream 1863582 7772165 ~ 7772378 (+) True XLOC_033453
TCONS_00065484 other downstream 1870380 7778963 ~ 7779176 (+) True XLOC_033454

Expression Profile


//