RNA id: TCONS_00065457



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00065457
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_033435
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 6697973 ~ 6698091 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TAGCCCAGTCATAtaaccctgcagcccaagactggctactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcaataTGGTAGTATGGGAGACCATATatgaaagctaggttgctgttgtaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119545

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068550 lncRNA upstream 445312 6249392 ~ 6252661 (+) True XLOC_033429
TCONS_00068770 lncRNA upstream 454543 5978658 ~ 6243430 (+) True XLOC_033427
TCONS_00068549 lncRNA upstream 640611 6053845 ~ 6057362 (+) True XLOC_033428
TCONS_00068548 lncRNA upstream 750846 5943810 ~ 5947127 (+) True XLOC_033416
TCONS_00068547 lncRNA upstream 870473 5826581 ~ 5827500 (+) True XLOC_033406
TCONS_00068771 lncRNA downstream 567591 7265682 ~ 7275388 (+) True XLOC_033443
TCONS_00068772 lncRNA downstream 577760 7275851 ~ 7279896 (+) True XLOC_033444
TCONS_00068773 lncRNA downstream 614615 7312706 ~ 7315975 (+) True XLOC_033445
TCONS_00068774 lncRNA downstream 722121 7420212 ~ 7422923 (+) True XLOC_033446
TCONS_00068775 lncRNA downstream 856669 7554760 ~ 7563288 (+) False XLOC_033450
TCONS_00065456 mRNA upstream 29549 6652967 ~ 6668424 (+) True XLOC_033434
TCONS_00065455 mRNA upstream 176216 6480212 ~ 6521757 (+) True XLOC_033433
TCONS_00065454 mRNA upstream 259433 6420435 ~ 6438540 (+) True XLOC_033432
TCONS_00065453 mRNA upstream 303307 6385664 ~ 6394666 (+) True XLOC_033431
TCONS_00065452 mRNA upstream 358396 6317866 ~ 6339577 (+) True XLOC_033430
TCONS_00065459 mRNA downstream 58182 6756273 ~ 6800564 (+) True XLOC_033436
TCONS_00065460 mRNA downstream 181443 6879534 ~ 6908640 (+) True XLOC_033437
TCONS_00065461 mRNA downstream 217518 6915609 ~ 6932033 (+) True XLOC_033438
TCONS_00065463 mRNA downstream 243492 6941583 ~ 7035227 (+) False XLOC_033439
TCONS_00065462 mRNA downstream 243492 6941583 ~ 7035227 (+) False XLOC_033439
TCONS_00065428 other upstream 1127779 5569548 ~ 5570194 (+) False XLOC_033402
TCONS_00065420 other upstream 1508077 5189778 ~ 5189896 (+) True XLOC_033396
TCONS_00065416 other upstream 1698702 4998793 ~ 4999271 (+) True XLOC_033393
TCONS_00065411 other upstream 1731636 4966092 ~ 4966337 (+) True XLOC_033390
TCONS_00065402 other upstream 1816286 4880423 ~ 4881687 (+) False XLOC_033375
TCONS_00065458 other downstream 58115 6756206 ~ 6800689 (+) False XLOC_033436
TCONS_00065469 other downstream 350165 7048256 ~ 7093901 (+) True XLOC_033440
TCONS_00065483 other downstream 1074074 7772165 ~ 7772378 (+) True XLOC_033453
TCONS_00065484 other downstream 1080872 7778963 ~ 7779176 (+) True XLOC_033454
TCONS_00065492 other downstream 1730863 8428954 ~ 8429919 (+) True XLOC_033460