RNA id: TCONS_00068773



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00068773
length 218
lncRNA type sense_over
GC content 0.54
exon number 2
gene id XLOC_033445
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 7279903 ~ 7373059 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TCTCTCCAGAGGAGTTTGAGTGTTTTGGATCGTCTTCTGCTCACACACTCCATATGGCTGCAGCTGTCAATCAACCCTGACTCCGCCCACCAAATCCTGCAGCGAGAGATAGTCGGGACTTTCCTGGTGTGTAAGTGCAGCGCCTCCCACAGGAAGGTTTTGTGTGTGCGGGTGCAGGAGGGAGGAGTGTCGCAATATCCTGTTCGTGAGGAAGATTC

Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068772 lncRNA upstream 32810 7275851 ~ 7279896 (+) True XLOC_033444
TCONS_00068771 lncRNA upstream 37318 7265682 ~ 7275388 (+) True XLOC_033443
TCONS_00068550 lncRNA upstream 1060045 6249392 ~ 6252661 (+) True XLOC_033429
TCONS_00068770 lncRNA upstream 1069276 5978658 ~ 6243430 (+) True XLOC_033427
TCONS_00068549 lncRNA upstream 1255344 6053845 ~ 6057362 (+) True XLOC_033428
TCONS_00068774 lncRNA downstream 104237 7420212 ~ 7422923 (+) True XLOC_033446
TCONS_00068775 lncRNA downstream 238785 7554760 ~ 7563288 (+) False XLOC_033450
TCONS_00065478 lncRNA downstream 239481 7555456 ~ 7563286 (+) True XLOC_033450
TCONS_00065480 lncRNA downstream 302061 7618036 ~ 7624545 (+) False XLOC_033449
TCONS_00068776 lncRNA downstream 1028744 8344719 ~ 8352307 (+) True XLOC_033457
TCONS_00065470 mRNA upstream 62917 7151832 ~ 7249789 (+) True XLOC_033442
TCONS_00065468 mRNA upstream 180841 7048245 ~ 7131865 (+) False XLOC_033440
TCONS_00065466 mRNA upstream 269573 7019911 ~ 7043133 (+) False XLOC_033439
TCONS_00065467 mRNA upstream 276140 7027199 ~ 7036566 (+) True XLOC_033439
TCONS_00065465 mRNA upstream 300745 6990510 ~ 7011961 (+) True XLOC_033441
TCONS_00065472 mRNA downstream 153787 7469762 ~ 7495887 (+) True XLOC_033447
TCONS_00065473 mRNA downstream 179059 7495034 ~ 7507488 (+) False XLOC_033448
TCONS_00065474 mRNA downstream 179130 7495105 ~ 7508747 (+) True XLOC_033448
TCONS_00065475 mRNA downstream 195939 7511914 ~ 7643941 (+) False XLOC_033449
TCONS_00065476 mRNA downstream 236033 7552008 ~ 7624101 (+) False XLOC_033449
TCONS_00065469 other upstream 218805 7048256 ~ 7093901 (+) True XLOC_033440
TCONS_00065458 other upstream 512017 6756206 ~ 6800689 (+) False XLOC_033436
TCONS_00065457 other upstream 614615 6697973 ~ 6698091 (+) True XLOC_033435
TCONS_00065428 other upstream 1742512 5569548 ~ 5570194 (+) False XLOC_033402
TCONS_00065420 other upstream 2122810 5189778 ~ 5189896 (+) True XLOC_033396
TCONS_00065483 other downstream 456190 7772165 ~ 7772378 (+) True XLOC_033453
TCONS_00065484 other downstream 462988 7778963 ~ 7779176 (+) True XLOC_033454
TCONS_00065492 other downstream 1112979 8428954 ~ 8429919 (+) True XLOC_033460
TCONS_00065497 other downstream 1354490 8670465 ~ 8681181 (+) True XLOC_033464
TCONS_00065500 other downstream 1725200 9041175 ~ 9046302 (+) True XLOC_033466

Expression Profile


//