XLOC_016313


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_016313
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 21195528 ~ 21208559 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00033805
CTAGTGCATATCAGCAAACAGGGTGAAAGCTGACTGGTCCTGTTCACTGTAAATCTACTTAAAATAAGattttttttgagAAGATAGAGGAGCAGACGAGAATTatgCATTCTCAAGAGGACTATTATGGAAAATGGTATCGATACTTCTTGTTCTGCGTTTGGATTTTGGACATTGTGTTGATATTTACCATGTATCACCTGAAAACACTGGTAAATGAACTAGTTCAAAAATATTCCTTGGACAAATgtcaagaaaaagaagaagacgaTGACGATTATGTCAACAGTGGTGCAATCGGCTACACATGCAACTTAGTTGTTTGAACCAGTAACTACTTAATGTCAATTTGCTCTCATACAAATACAGCAGTTCAAAGAGAGAGACTTTAACTGGAGTATACTTCACTGAATGTGTTTTTTCCACTCCATTTAACTCTGTCATGTTTTGTTGCCATCAGCAATATAGCAATAATAGTGTCATATTAGGTGAttctgataaataaaatgtttggttTAGGTTAATATAAAGAAATGAAAATGTACCAGAATAGTATTAAtcaccttttttttcttcttgtcaCATATAATCTGATAAGGGGTTTTTATTAGGACTCATTTATAAGTACCATCTTAATCGACTAGTTATATTATAAACAACAAAGTTTGGTTAAAAAGAAGAACAAGATGTTCATGCTTAAAACAATGTGTGATACGCAAGGCGTAAAATTTGTTAGCACCAAGTGTGGCCAATTTCTTTCAAATTCTCACGAAGGCTGCTGACTTGTTTCCTGGATGCCTAATTAGGTAGTGACTTCAGAGGCATGATTACTGCAGGGCACCTCATAAAAAGACAGTATAGCCATTTGATGACTTACAACATAACTTttatgatcaccagtgatctaacaGTTACAGATCGCTGGAAAACTACACATCTGCCTCTTTAACTACGactcccagaagtcattgctccAATCACTCCTGCCAAAGCCGACAGTCATCCGAACTCTGGCACACTTACACAGCTGAATGATTACTTGGACTATATATacaccacacattcacacaaactttgctgagtcttgtttttgtttttgacacttgccttgtttattgttttctgttgtttgCCGCCTGTATCGACCATTTGCCTGTGACTTGACTTCGCTTCTGGATTGCCCTGTACCAGTTTgctcatgtgattggctgttgccTGTCTGACGATTCCAAATAAAGCTGCACATGG
>TCONS_00033806
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>TCONS_00032152
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00033805 False 1248 lncRNA 0.37 3 21195528 21197037
TCONS_00033806 False 2768 lncRNA 0.36 4 21195528 21208559
TCONS_00032152 True 1719 lncRNA 0.35 3 21205788 21208102

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_016312 bmi1b coding downstream 25011 21164930 ~ 21170517 (-)
XLOC_016311 NA coding downstream 71413 21122188 ~ 21124115 (-)
XLOC_016310 nebl coding downstream 112833 21076585 ~ 21082695 (-)
XLOC_016309 nrn1b coding downstream 201402 20991985 ~ 20994126 (-)
XLOC_016308 lyrm4 coding downstream 213621 20980162 ~ 20981907 (-)
XLOC_016314 CU464125.1 coding upstream 104183 21312742 ~ 21320684 (-)
XLOC_016315 klhl40a coding upstream 118398 21326957 ~ 21352101 (-)
XLOC_016316 NA coding upstream 172766 21381325 ~ 21383394 (-)
XLOC_016317 plcd1b coding upstream 179343 21387902 ~ 21438492 (-)
XLOC_016318 NA coding upstream 333047 21541606 ~ 21542043 (-)
XLOC_016303 FO681336.1 non-coding downstream 437829 20757582 ~ 20757699 (-)
XLOC_016302 AL954134.1 non-coding downstream 491005 20699481 ~ 20704523 (-)
XLOC_016298 NA non-coding downstream 732605 20453614 ~ 20462923 (-)
XLOC_016319 NA non-coding upstream 362577 21571136 ~ 21593060 (-)
XLOC_016326 NA non-coding upstream 1056823 22265382 ~ 22268977 (-)
XLOC_016299 NA non-coding downstream 736519 20457947 ~ 20459009 (-)

Expression


Co-expression Network