LOC118944683


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944683
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 36610735 ~ 36618726 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036965035.1
aTGGTACAGTCACTCCCTGGTCACTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCTGGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCGCTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCTGGTCACTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCTGGTCACTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCGGGTCACTCACCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTTGCTTCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTTGCTTCCATGTCACTCCCCGGTCACTCCTCGTCACTCCCCTgtcactccctctcactcccctGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCATCACTCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGTCACTCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCACTCCACAGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCGCTCCCCGGTCGCTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCCGGTCACTGCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCGCTCCCTGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCTGGTCACTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTGCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCTGGTCACTCCCCGGTCATTCCCCTGTCACTCCACAGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCGCTCCCCTGTCGCTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCATCGGTCACTCCCCTGTTGCTTCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTTGCTTCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCTCGTCACTCCCCTTacactccctctcactcccctGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGTCACTCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGTCACTCCCTGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCGTCACTCCCCGTCACTCCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCCGTCACTCCCCTATCACTCCCCGTCACTCCCCGGTCACTCCCCTGTCACTCCCCTGTCACTCCCTGGGCCATGCTCCGCTCCATTACTCTCTGCCAGGCCTTTGGGGCTCTGTGTGGAGCCTGGGGGCTGGGTAGAGAGCTTCCCCAGGCAGGTTGAAGGCTGCTGGGGCAGGGGCCGGCTTGAGTTGGGCCTACAGACGGTGATGGATGGAGGCCTGAGACTAAGGGCCAACTGA

Function

NR:

description
PREDICTED: filaggrin-2-like isoform X10

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036965035.1 True 2457 mRNA 0.67 3 36610735 36618726

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110507218 LOC106591049 coding upstream 64238 36453761 ~ 36546497 (+)
LOC110508005 LOC106613226 coding upstream 170026 36438225 ~ 36440709 (+)
naalad2 LOC106581411 coding upstream 229724 36365655 ~ 36381011 (+)
LOC110507977 fzd4 coding upstream 598401 36005425 ~ 36012334 (+)
LOC110507976 LOC106581370 coding upstream 787851 35804534 ~ 35822884 (+)
LOC118936607 LOC106581404 coding downstream 60047 36678773 ~ 36703523 (+)
LOC110507948 LOC106581405 coding downstream 89200 36707926 ~ 36863967 (+)
LOC110536894 NA coding downstream 412435 37031161 ~ 37276857 (+)
mre11a mre11a coding downstream 699990 37318716 ~ 37357606 (+)
trnat-agu-151 NA coding downstream 886835 37505561 ~ 37505634 (+)
G2078872 NA non-coding upstream 13032 36597385 ~ 36597703 (+)
G2078871 NA non-coding upstream 14013 36596507 ~ 36596722 (+)
G2078855 NA non-coding upstream 30017 36579545 ~ 36580718 (+)
G2078854 NA non-coding upstream 31302 36579057 ~ 36579433 (+)
G2078911 NA non-coding downstream 46329 36665055 ~ 36665813 (+)
G2078933 NA non-coding downstream 56595 36675321 ~ 36675523 (+)
G2078942 NA non-coding downstream 62815 36681541 ~ 36682209 (+)
G2078948 NA non-coding downstream 79052 36697778 ~ 36698244 (+)
G2078949 NA non-coding downstream 82694 36701420 ~ 36701951 (+)
G2078493 NA other upstream 308693 36263506 ~ 36302664 (+)
G2078425 NA other upstream 506634 36102874 ~ 36104101 (+)
G2078382 NA other upstream 576736 36033285 ~ 36033999 (+)
G2078296 NA other upstream 678226 35932115 ~ 35932509 (+)
G2079197 NA other downstream 660379 37279105 ~ 37280832 (+)
G2079468 LOC106581367 other downstream 748013 37366739 ~ 37368136 (+)
G2079657 NA other downstream 1197152 37815848 ~ 37819286 (+)
G2080014 NA other downstream 1326206 37944932 ~ 37945151 (+)

Expression


Co-expression Network