XLOC_004116


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_004116
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 21893602 ~ 21906060 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00008789
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00008791 True 1526 lncRNA 0.41 3 21893602 21906060

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_004114 BX537291.1 coding downstream 281292 21582560 ~ 21612310 (-)
XLOC_004113 srgap2 coding downstream 307445 21405697 ~ 21586157 (-)
XLOC_004112 ikbke coding downstream 489244 21364551 ~ 21404358 (-)
XLOC_004111 RASSF5 coding downstream 529768 21278687 ~ 21363834 (-)
XLOC_004117 NA coding upstream 183375 22089435 ~ 22094397 (-)
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XLOC_004013 CABZ01022569.1 misc downstream 9302306 12590999 ~ 12591296 (-)
XLOC_004008 BX000700.19 misc downstream 9380340 12512966 ~ 12513262 (-)
XLOC_004108 NA non-coding downstream 773629 21117620 ~ 21119973 (-)
XLOC_004104 NA non-coding downstream 940353 20952056 ~ 20953249 (-)
XLOC_004096 BX511159.1 non-coding downstream 2477287 19416178 ~ 19416315 (-)
XLOC_004095 CT737428.1 non-coding downstream 2713047 19180452 ~ 19180555 (-)
XLOC_004123 CR555297.1 non-coding upstream 1253129 23159189 ~ 23159307 (-)
XLOC_004125 BX571675.2 non-coding upstream 1399695 23305755 ~ 23309318 (-)
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Expression


Co-expression Network