G148260


Basic Information

Item Value
gene id G148260
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056720.1
NCBI id CM032089.1
chromosome length 18002998
location 1409917 ~ 1417452 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU219106
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>TU219109
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>TU219111
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>TU219113
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko00563 Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU219106 True 2887 lncRNA 0.38 2 1409917 1417452
TU219109 False 1139 lncRNA 0.43 2 1411088 1417452
TU219111 False 1723 lncRNA 0.43 2 1411088 1417452
TU219113 False 1566 lncRNA 0.40 2 1415305 1417452

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122327924 LOC107566706 coding upstream 63366 1312013 ~ 1346551 (+)
LOC122328020 LOC568664 coding upstream 124803 1274434 ~ 1285114 (+)
LOC122328021 LOC568664 coding upstream 181334 1222696 ~ 1228583 (+)
LOC122328116 NA coding upstream 273812 1134471 ~ 1136105 (+)
LOC122327961 LOC107711386,LOC107579500,LOC107662827 coding upstream 284987 1122850 ~ 1124930 (+)
LOC122327991 NA coding downstream 4907 1422359 ~ 1423773 (+)
trnam-cau_116 NA coding downstream 14853 1432305 ~ 1432377 (+)
LOC122327918 LOC107710809,LOC107574827,LOC107667624,LOC107698297,LOC107575765,LOC107570670 coding downstream 20339 1437791 ~ 1445372 (+)
LOC122327926 LOC568664 coding downstream 85061 1502513 ~ 1508321 (+)
LOC122327993 NA coding downstream 174708 1592160 ~ 1596619 (+)
LOC122328038 NA non-coding upstream 3810 1401845 ~ 1406107 (+)
G148251 NA non-coding upstream 50622 1340237 ~ 1359295 (+)
LOC122328044 NA non-coding upstream 71001 1336118 ~ 1338916 (+)
G148226 NA non-coding upstream 219393 1183520 ~ 1190524 (+)
G148219 NA non-coding upstream 359007 1050685 ~ 1050910 (+)
G148224 NA non-coding downstream 71947 1489399 ~ 1546893 (+)
LOC122328048 NA non-coding downstream 73992 1491444 ~ 1492481 (+)
G148299 NA non-coding downstream 225658 1643110 ~ 1644215 (+)
G148312 NA non-coding downstream 282452 1699904 ~ 1777171 (+)
G148316 NA non-coding downstream 290986 1708438 ~ 1782010 (+)
G148222 NA other upstream 25070 1379291 ~ 1384847 (+)
LOC122327965 NA other upstream 261115 1137717 ~ 1148802 (+)
G148233 LOC107571167,LOC107662825,LOC107663547 other upstream 282687 1125486 ~ 1127230 (+)
G148214 wdr77 other upstream 393250 1015779 ~ 1016667 (+)
G147888 LOC107732183,LOC107723096,LOC107572363,LOC107698292,LOC107750676,LOC107656899 other upstream 615911 791234 ~ 794006 (+)
LOC122328040 NA other downstream 204540 1621992 ~ 1880883 (+)
G148295 NA other downstream 207020 1624472 ~ 1625190 (+)
LOC122327950 NA other downstream 209110 1626562 ~ 1639006 (+)
LOC122327951 NA other downstream 437415 1854867 ~ 1857142 (+)
G148388 NA other downstream 726433 2143885 ~ 2145560 (+)

Expression


Co-expression Network