G62996


Basic Information

Item Value
gene id G62996
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056706.1
NCBI id CM032075.1
chromosome length 24299999
location 11351311 ~ 11394149 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU93265
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>TU93268
gttttattcagtttatttctgTAACTGCATGTCATTATTCATAATTCAAAACTCCCTGTTGATGCATTCAAAAACAATACAGTATCTTCATACATATCAAGAGCAACAATTAAAAACCTGTACATCTGTGTTCAAGGTGTCCCCTCACGGACTGCTATTTACACACTCAGCATCTTCCCTGCAGAGGACGCCACTAAAATAACGGCTACTCGAGGTCTGGAGGACTTCAGACCCGGCAGGTAAAAATCTGCAACACACTGCTGCCTGCTTCCTCATTTTCTATACTTGAGAGTCCTGTTTACGCTAAGTCAAAATGAAGGAGAGGACGCTTATGCTATAAAGGAAGTACAACCTTTACACAGGAGCTGTCAGAATGAGTTTTTCAGCCCCATCTGAACACTTGAAGTAGTTTTAACTGCTTTCCGCTGGCTTGCAAGTGGCGACCTCCGTATGCACTGAATGGGGGAAAGCGAAACAGTGACTGCAGCCAGCCAGTTGGAGGATCAGCACCAATGAAGGAAAAGAGCTCACAAGAATTCAGACCGGGCGGCTGCCTTAGAGAGGTTCTCTACTTCCTTTATATGACAGAATGTCCTCTGCTTTCATTATCGTGGGCCGAGCTGTCTGGCACGCAGGGGTGTGAAAAGAATTGAGAAATTATGCTGAAGTTATGGGTACGGTGTCAGATGTTTAGAGTAATTAGTAAAATAACGTATTCAAATTAAAGTACAAAAGTTTGCACGttgtactttatatttaaacGTCTTTTTAGAAATAGACGAGACATGaaagcaatttaataaaatgaaaaagtgagaTTTTCTCATTTCAGTTTCTGCATAAGCTACACAGAATTTAGCATTATCAGTGTGttcgaattaaaaaaaaaagccagccTGAAGTTAtcattaaattgttattaaattattattatttatttactatattctttatatttgttttagttaaagTAACTTTAGTAagatgcttattttatttaggttAGTTGTCAATGCaacatttcaatttttattgtttagtttcAAGTGTAAATAATTCatctaattttttattttatttcagtttatctcAGTTTattgatgaaaaacatttttagtagcTGTGGTTAACAATATCATTACCGGTTCATCGCCAACAGTTTTCTCACTTCAGTCATATTAGTCTTATAATAAGAGTGCATGTAATATCAATAAGGccaaatacatattcatatggcatattcaaatttcaaatgGCTTTTTCTCTTACAAattttcagtttcaaataataattctaataacgGAGTACAATCGCTCAAGCACTTTACACCCCTGCCGCCTTCTATCCTATATTTCTagaatatagatataaaaacatCTCCTTTTCATTCctctttacaaataaaagtgttcTTGTTCTGTACAATGGCTGACTCCTTACAAGGCCAATATAGCAAATTCAAGTTGAAAATTCAAAGCTGAAACACTCCGTTTgtgatttgacattttaaaagcgTCAAACTCAGAGGGCCAAGCGCCCATCTGCATTTCTCTCGGTAGAGGGAAAGAGTATGACATCATTGATTAGCATTTAAATGGCACATTTGCACTGATAGGAACCTTGCggacattattataataaaaaccaaaaaaaacaaccaaaaaaaaacaaaacaagaaaaaacattgcatCACTGTATTCATATATCAGAGTATGGCTCGACCTTGAGACTACATCTGACTACTGAACACCTAAGGGTCTAAACTGTCTCCAGTACAAGGACACCTATATGGAGCACACATGTTCAGTGGGCATGCTAATTCTTATTTTTGAGGACTACGTAATTGTGGTCTTTGTGTCTCTAAATCTTGCTTTTAATATGTTGTTGAAGATGTCATGAAGAGGAATATAAAAAGACGGTCAGAGTGTGCAAAAACCACAGTGGGCACTAGGGGGCAATCAAGCTGTCAGATCAGATTCCACGATTTGAATAATTTGAAACTGGCAACAGATGTTGTATAAAACATTGCAATTGGCCTCCTGGGCTGTGGAATACAGTATCATGCCATGGGGACGTTTAATTTCATTGTAAGGGCCAGTGCTATTAAAACTAGTATACTCACTACAGACATGCAAGATTGAATTATaagaatcattttatatatcaaGCTTCTCGTCAAGCCAGTGGGCACCTCGGTTTAAAACGCTGCACCTGTCTCAGGATAACTCGACAGTGCTGTATATTTCTGATATGTGAgattgggggggaaaaaaaaataaaagtccagATATGtctataattatatacaataagCTTGTTTTCTCAGAAGATCTGCTACAGTAAGGGAAATGCtacagtttgaatgtttttggaaaaaacaaacaaacaaaaaaaacaacgactAAATCTTCCCCCTCCCAAAAATAAACCCAAACTAAACATTTACAAGGCTCATCCCAGTTTCTGTACAGTACGTGCTGATGCCAATGGGATAATCAGGTACAAAGTCAACATCAATACCCAGGCTGGTTGAGGATTCTGAGAGCAGTGAACGTCAGATGACACCTCAGATGTAATACTCATGTAGAAGCCCTGATTTAAAGTGTTAACACTTAAGATCGATCCAATTGCAAATTGCTAAATGCTTACAGGCTGTGAATGGTAACGAAACTGGCATGTGATCTCCTATGTAAGCATTTCTTGATATGTTACAGCACAGTAAACGCCACCAGTGATAAATTATAACATGTTcgattgtatttttaaaatccgCCCGATTCAATTGTCTTTagaatatttaaatcaattcagATGGGCGcaataaaatagtatttcatCTTGTATGTATACGgggatgcattttatttgaattcatttatcACAGATGATtttactgtgcatatttctaGCACTCAGCTTTCCGATGAGCCTGCCTAGAGCTTAGCTTGGTATGACACAGAACAGAAAGAGATAGCACTTATTGCTCAGACAGTTCTGAGGTAAAGATCGATGCATAAGCTGGTGGTACAGCATGTCTGATTATCACCGGATCTCCTTTAAATTTTCGATTCACCAACCTGCCTGTGTATTTTAACAGTACACAAAATTACGAATCTCATATCTTAGGTAGAAAAATCCTACCGCAATTTTTGATCAGTAAGTCTTACAAAATGCATAGAAGACCTGTATCAAAATgccctttttcttcttcttggttttttttgttttgtttagtttttttttcctttttgtctcCTGAAATGAAGATTCCGATGATGCTCGATGCTGATTGGTGGAGGGCTTGGAATGAGGACCGATCAGGccttcgtttttgtttttttctcgaTTTCTCAGAAATGTTAAGGGCAATGAAATGGGTCTGAAATACTGATTCGGAAAgcatacaaatgcaaaaaagtatcacaatgggaaaaaaatcaaaactttGGGTCCTGATTTTCAGCTTGAGGGAAGTCTATGTCTCGTATAAAGGAATATCGCATGAGGCACTTGTAATGGCTCTCTTTCACTTTGACTCACTTAGCTGAAGTTTCGCAGAGCGTGTGCAGAATATTTTCCCCAACTTGTGAACCAAGTCTTGCAAAGATATAGATGTTAAAGAGGCAGAACAGTATTGTGTTGCACACTTTCTACTATGCTACGTCTTATGTTCTTTTACTTgtatttgtttctcttttttttttttggtaaacacTGGCTAAAGAAGCAGAAGGCACCTGGAGAGGTTTGATACGGCTCACTGGCCTTATAATAAAACTTTAGTTCTGTTATCTTCCTTCCCCCCTCTTTCAACAGCAAGACCACCGCGCACACAGCAGGGGAGGGGTTACAGTCCAGTCACAAACAGCAAgcagctaataaaaaaatctctttaatcGCTTAGCCCTGCTCCTGAAGATCCATATTCGATCTAGTTTACTTTAAGAAATCTAGCTCTTCAGGGGCACGACTGAGTGACCGTGTCTTAAAtaaattttcctttttataatagaatttttgttgcattcttacgaaaataaatggaaaatatgctaaataaaaatgtcaatgatTATGAAAAGACGCATGCTATGAAGGACATCATGAATCATAGACGCATACTAACTGACCTTGCAGTTACTGTCATGCTAGCCACAGCTTAATGGCAGCATTTGCTCATTTTCTCTCCTTGGCCACTGGATGGCGATAAAATCAAGGAGTGATTGGCCAGGGTGAGAGATTTGTGCAGTATCTGGATGACACCAGTACCGCAGTTCTAGTACTATATAGATATGGATTTGAGACGGAAGAGAAACAGATGGGGTGGTGTACTGAAAACCACATATATAGAGACAGAGCTGGAGAGGTTGGATGAGAGAGATTGTGTGTCtgcgtttttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtTTGTGTggaagtgtgtatgtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU93265 True 4984 lncRNA 0.39 2 11351311 11392665
TU93268 False 4451 lncRNA 0.38 2 11351311 11394149

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pdzd4 LOC107731264,LOC107745768,LOC107695297,LOC107549432 coding upstream 67102 11258547 ~ 11284209 (+)
rassf11 LOC107731195,LOC107550001,LOC107668034,LOC107695295,LOC107549421,LOC107745822 coding upstream 115827 11232914 ~ 11235484 (+)
LOC122350459 LOC107668090 coding upstream 128380 11219320 ~ 11222931 (+)
LOC122350456 NA coding upstream 132668 11212458 ~ 11218643 (+)
tnfrsf14 NA coding upstream 138999 11207202 ~ 11212312 (+)
cacna1fb cacna1fb,LOC107668072,LOC108437577,LOC105898895,LOC103460216 coding downstream 3229 11397378 ~ 11429768 (+)
sypa sypa,LOC107731262,LOC107549993,LOC107668097,LOC107549468,LOC107745764,LOC107695302,LOC108437576 coding downstream 39172 11433321 ~ 11441823 (+)
samd10a samd10a,LOC107731152,LOC107668017,LOC107745835,LOC107695303,LOC108437575 coding downstream 59432 11453581 ~ 11467956 (+)
uckl1a uckl1a,LOC107549990,LOC107668066,LOC108437574,LOC103355333 coding downstream 74272 11468421 ~ 11483679 (+)
nkain5 LOC107668065,LOC107745763,LOC107731206,LOC107549956,LOC107695305 coding downstream 112683 11506832 ~ 11512190 (+)
G62909 NA non-coding upstream 78453 11157008 ~ 11272858 (+)
G62904 LOC107549999,LOC107731193 non-coding upstream 103017 11156018 ~ 11248294 (+)
LOC122350460 NA non-coding upstream 146764 11203829 ~ 11204547 (+)
G62896 NA non-coding upstream 208215 10971712 ~ 11143096 (+)
G62897 NA non-coding upstream 377345 10973247 ~ 10973966 (+)
G63024 emilin3a,LOC107731182,LOC107668027,LOC107745820,LOC107550125,LOC107549958,LOC107695222 non-coding downstream 52884 11447033 ~ 11447271 (+)
G63052 NA non-coding downstream 124261 11518410 ~ 11522911 (+)
LOC122350248 NA non-coding downstream 221318 11615467 ~ 11620167 (+)
G63094 NA non-coding downstream 224870 11619019 ~ 11619230 (+)
LOC122350251 NA non-coding downstream 355411 11749560 ~ 11752585 (+)
G62940 LOC107668028,LOC107745767,LOC107695299,LOC107549994 other upstream 39878 11294805 ~ 11311433 (+)
LOC122350428 LOC107668044,LOC107731208,LOC107555595 other upstream 153508 11192724 ~ 11197803 (+)
fhad1 LOC107731229,LOC107695278,LOC107550056,LOC107667985,LOC107555592,LOC107745840,LOC107745827 other upstream 799520 10536143 ~ 10551791 (+)
G62692 cry1ba,LOC107578471,LOC108441644,LOC107668038,LOC101164536,LOC108265656,LOC103358259 other upstream 872512 10431802 ~ 10478799 (+)
col2a1a col2a1a,LOC107585898,LOC107668081,LOC107695274,LOC107549173,LOC107731244 other upstream 983448 10348914 ~ 10367863 (+)
plp2a NA other downstream 47820 11441969 ~ 11445008 (+)
slc17a9a slc17a9a,LOC107731251,LOC107668105,LOC107549987,LOC107745761,LOC107549524 other downstream 140351 11534500 ~ 11541121 (+)
ppdpfa ppdpfa,LOC107678627,LOC107549986,LOC107745755,LOC107668053,LOC107731217,LOC108412507,LOC103034602 other downstream 168132 11562281 ~ 11564408 (+)
fance LOC107731142,LOC107668098,LOC107549969,LOC107678824,LOC107745739,LOC107591838,LOC107577385 other downstream 422908 11817057 ~ 11820659 (+)
si:ch211-163l21.10 LOC107731153,LOC107549947,LOC107668018,LOC107745734 other downstream 459445 11853594 ~ 11857421 (+)

Expression


Co-expression Network