G76201


Basic Information

Item Value
gene id G76201
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000012
NCBI id null
chromosome length 13770000
location 12525488 ~ 12534730 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU86947
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>TU86946
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>TU86948
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AGCATGCATGAATAAAAGTCGAAATAAGCATCCCAAGAGATGTCAATAATATTTCAGATTTACAAAACTAGTCTTAAAAAGAGCGAACCTTGAGAGAAGAGGCGCTCCTTCTCGCTCGCTCTTTCAGTGCCTGAGGTCGGAGTCGGACCACATCATAGCGCATCACATGAGGCAAAGCTGGATTCGCTGCCTCAAGATTTTCTAAAGCAGCAGTGAATAAACAAATCATCAGTATGTGTAATCAGTAAATTAAAAACACATCACGCAATGTGACATGGCTCGTGCTGTAAATGAATCCTCATAATGCTGTGCGCTCACCCCATGTATAAACAAAAGAAAGCAGTGAAATAAATAATCCAGTGTATCGCATGGTTGAATGTCCTGTGGACTCGCTTCGGGACTCGTGGTCTGCTGTGGGAACACAGATACTTGAAAGTTAAAGCTCCGCCTCGGTTATCCGGTAAATTAGCATAAACATATTACGACCTCCTTATCCGGTAACAGCAAACTGGTCTCTAATGAGTTACAGCCCTGTAAATGTGTCAGTATTTTCGTGAAACGTCAACAGTAAAAAAAAAAATTGTTATCTTTTTTTCCCCCGGCTAGGCTTATAGGCTGCCACACAGTTTGGTAGATTTTGTAGTTCATTCCTGTTAAGCTCACTAAATTATAATTTGATTGGTAATACACTGTCAAAACAATTAACAAGATCCTAAACAGAATGTGAAGCTTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU86947 False 8149 lncRNA 0.36 6 12525488 12534730
TU86946 False 5853 lncRNA 0.35 3 12528637 12534730
TU86948 True 5733 lncRNA 0.36 3 12528637 12534730

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000012_12505469_12509093 ERLIN1, ERLIN2 coding upstream 16172 12505469 ~ 12509316 (+)
CI01000012_12489485_12490402 NA coding upstream 35057 12489287 ~ 12490431 (+)
CI01000012_12440074_12465741 SLKA, SLKB, SLK coding upstream 59456 12440074 ~ 12466032 (+)
CI01000012_12381049_12417489 KAT6B coding upstream 106791 12380192 ~ 12418697 (+)
CI01000012_12378120_12378419 NA coding upstream 146826 12378120 ~ 12378662 (+)
CI01000012_12536242_12538668 NA coding downstream 1346 12536076 ~ 12538728 (+)
CI01000012_12585843_12587149 NA coding downstream 51113 12585843 ~ 12587209 (+)
CI01000012_12621489_12646263 NA coding downstream 86608 12621338 ~ 12646399 (+)
CI01000012_12653960_12664480 SLC1A4 coding downstream 119101 12653831 ~ 12665121 (+)
CI01000012_12667656_12672197 NA coding downstream 132926 12667656 ~ 12672247 (+)
G76239 NA non-coding upstream 1507 12517066 ~ 12523981 (+)
G76341 NA non-coding upstream 21958 12503212 ~ 12503530 (+)
G76340 NA non-coding upstream 24158 12501120 ~ 12501330 (+)
G76335 NA non-coding upstream 25831 12496835 ~ 12499657 (+)
G76332 NA non-coding upstream 32639 12492649 ~ 12492849 (+)
G76235 NA non-coding downstream 4913 12539643 ~ 12541080 (+)
G76234 NA non-coding downstream 6859 12541589 ~ 12542061 (+)
G76249 NA non-coding downstream 55977 12590707 ~ 12591506 (+)
G76225 NA non-coding downstream 60304 12595034 ~ 12599097 (+)
G76361 NA non-coding downstream 66459 12601189 ~ 12601408 (+)
G75533 NA other upstream 1379749 11144817 ~ 11145739 (+)
CI01000012_10223957_10235955 NA other upstream 2301201 10223697 ~ 10236276 (+)
G73578 NA other upstream 4157861 8366806 ~ 8367627 (+)
CI01000012_07806089_07811902 BEND3 other upstream 4717633 7805248 ~ 7811902 (+)
CI01000012_05923216_05928055 SRD5A2B other upstream 6601183 5922385 ~ 5929186 (+)
G76385 NA other downstream 96025 12630755 ~ 12675666 (+)
G76374 NA other downstream 210801 12745531 ~ 12749169 (+)
CI01000012_13029637_13033226 RGS17 other downstream 480776 13029435 ~ 13038899 (+)
G76645 NA other downstream 1117129 13651859 ~ 13652234 (+)
G76656 NA other downstream 1168757 13703487 ~ 13739731 (+)

Expression


Co-expression Network