G87223


Basic Information

Item Value
gene id G87223
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000015
NCBI id null
chromosome length 8631711
location 1379681 ~ 1398822 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU99324
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description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU99324 True 19142 lncRNA 0.35 1 1379681 1398822

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000015_01349369_01366864 ZNRF4, RNF13 coding upstream 12170 1349369 ~ 1367511 (+)
CI01000015_01307849_01327079 SRFA, SRF coding upstream 51305 1306824 ~ 1328376 (+)
CI01000015_01288157_01300925 NA coding upstream 78550 1288157 ~ 1301131 (+)
CI01000015_01080504_01101091 NA coding upstream 278298 1080504 ~ 1101383 (+)
CI01000015_01020856_01025441 HOGA1 coding upstream 354028 1020856 ~ 1025653 (+)
CI01000015_01405454_01407722 NA coding downstream 6159 1404981 ~ 1409173 (+)
CI01000015_01412031_01434518 RUBCN coding downstream 13209 1412031 ~ 1434518 (+)
CI01000015_01580548_01582805 TCTEX1D2 coding downstream 181726 1580548 ~ 1583078 (+)
CI01000015_01638133_01646368 HYKK.2, HYKK coding downstream 236604 1635426 ~ 1646409 (+)
CI01000015_01688642_01691631 NA coding downstream 289820 1688642 ~ 1691941 (+)
G87216 NA non-coding upstream 4006 1368214 ~ 1375675 (+)
G87355 NA non-coding upstream 43151 1336299 ~ 1336530 (+)
G87220 NA non-coding upstream 73771 1302221 ~ 1305910 (+)
G87337 NA non-coding upstream 94404 1278270 ~ 1285277 (+)
G87372 NA non-coding downstream 76288 1475110 ~ 1475479 (+)
G87373 NA non-coding downstream 78547 1477369 ~ 1477960 (+)
G87385 NA non-coding downstream 98427 1497249 ~ 1497524 (+)
G87413 NA non-coding downstream 157620 1556442 ~ 1556826 (+)
G87432 NA other downstream 212261 1611083 ~ 1611387 (+)
G87972 NA other downstream 477182 1876004 ~ 1876594 (+)
G88172 NA other downstream 985194 2384016 ~ 2526510 (+)
CI01000015_02512276_02523824 NA other downstream 1113276 2511546 ~ 2524572 (+)
CI01000015_03011472_03026518 NA other downstream 1624174 3011472 ~ 3026636 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
eurasian perch (Perca fluviatilis) G90112 NA non-coding NC_053119.1 CM020916.1 35509887 ~ 35511768 (-)