RNA id: TCONS_00023839


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00023839
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_012087
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 22786174 ~ 22786291 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaccctgcagcctaaCCCcgggttactcactgaagctaagcagggctgagcctagtcagtaccttgatgggagactacatggggaaactaggttgctgttgcag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116131

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024895 lncRNA downstream 96387 22687170 ~ 22689787 (-) False XLOC_012086
TCONS_00023837 lncRNA downstream 96387 22687170 ~ 22689787 (-) True XLOC_012086
TCONS_00023838 lncRNA downstream 96542 22687170 ~ 22689632 (-) False XLOC_012086
TCONS_00023834 lncRNA downstream 214191 22570700 ~ 22571983 (-) False XLOC_012085
TCONS_00023829 lncRNA downstream 260429 22521636 ~ 22525745 (-) False XLOC_012083
TCONS_00024896 lncRNA upstream 696768 23483059 ~ 23485336 (-) True XLOC_012093
TCONS_00023851 lncRNA upstream 841285 23627576 ~ 23631411 (-) True XLOC_012098
TCONS_00024897 lncRNA upstream 864243 23650534 ~ 23652336 (-) False XLOC_012099
TCONS_00024898 lncRNA upstream 1199582 23985873 ~ 23987510 (-) True XLOC_012103
TCONS_00024540 lncRNA upstream 1237016 24023307 ~ 24026857 (-) True XLOC_012104
TCONS_00023832 mRNA downstream 212772 22563836 ~ 22573402 (-) False XLOC_012085
TCONS_00023833 mRNA downstream 212803 22565703 ~ 22573371 (-) False XLOC_012085
TCONS_00023835 mRNA downstream 212862 22571891 ~ 22573312 (-) False XLOC_012085
TCONS_00023836 mRNA downstream 212863 22572300 ~ 22573311 (-) True XLOC_012085
TCONS_00023831 mRNA downstream 233496 22544648 ~ 22552678 (-) True XLOC_012084
TCONS_00023841 mRNA upstream 426436 23212727 ~ 23221504 (-) True XLOC_012089
TCONS_00023842 mRNA upstream 450948 23237239 ~ 23241393 (-) True XLOC_012090
TCONS_00023843 mRNA upstream 624911 23411202 ~ 23416897 (-) False XLOC_012091
TCONS_00023844 mRNA upstream 624981 23411272 ~ 23412705 (-) True XLOC_012091
TCONS_00023845 mRNA upstream 647920 23434211 ~ 23446760 (-) True XLOC_012092
TCONS_00023820 other downstream 775506 22002857 ~ 22010668 (-) False XLOC_012077
TCONS_00023811 other downstream 927010 21833724 ~ 21859164 (-) False XLOC_012072
TCONS_00023801 other downstream 1505989 21279873 ~ 21280185 (-) True XLOC_012064
TCONS_00023793 other downstream 1655797 21130261 ~ 21130377 (-) True XLOC_012061
TCONS_00023786 other downstream 1807222 20966835 ~ 20978952 (-) True XLOC_012057
TCONS_00023840 other upstream 138918 22925209 ~ 22925337 (-) True XLOC_012088
TCONS_00023856 other upstream 876920 23663211 ~ 23666478 (-) True XLOC_012099
TCONS_00023885 other upstream 2077420 24863711 ~ 24866653 (-) True XLOC_012119
TCONS_00023894 other upstream 2131059 24917350 ~ 24937879 (-) False XLOC_012122
TCONS_00023896 other upstream 2142852 24929143 ~ 24937535 (-) False XLOC_012122