RNA id: TCONS_00025607


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00025607
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_012835
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 27196210 ~ 27196326 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TgttgctggcagctagctctctgcaactctcacatggttgcccactgaagctaagcaggattGCACTCGGTCagcacctggatgggagaccacctGGGAAAGCTAGATTGGTGAGAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179156

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00026904 lncRNA upstream 197621 26997576 ~ 26998589 (+) True XLOC_012832
TCONS_00027119 lncRNA upstream 734783 26456681 ~ 26461427 (+) True XLOC_012825
TCONS_00026901 lncRNA upstream 1696602 25477794 ~ 25499608 (+) True XLOC_012816
TCONS_00025618 lncRNA downstream 375162 27571488 ~ 27614703 (+) False XLOC_012839
TCONS_00025634 lncRNA downstream 1960501 29156827 ~ 29174491 (+) False XLOC_012848
TCONS_00025635 lncRNA downstream 1960523 29156849 ~ 29163114 (+) False XLOC_012848
TCONS_00025646 lncRNA downstream 2933445 30129771 ~ 30131831 (+) False XLOC_012854
TCONS_00025647 lncRNA downstream 2933470 30129796 ~ 30131831 (+) False XLOC_012854
TCONS_00025604 mRNA upstream 110382 27077853 ~ 27085828 (+) True XLOC_012833
TCONS_00025603 mRNA upstream 110605 27077853 ~ 27085605 (+) False XLOC_012833
TCONS_00025601 mRNA upstream 117991 27000850 ~ 27078219 (+) False XLOC_012833
TCONS_00025600 mRNA upstream 117991 27000850 ~ 27078219 (+) False XLOC_012833
TCONS_00025602 mRNA upstream 123073 27001115 ~ 27073137 (+) False XLOC_012833
TCONS_00025608 mRNA downstream 22411 27218737 ~ 27306096 (+) False XLOC_012834
TCONS_00025609 mRNA downstream 104374 27300700 ~ 27306096 (+) True XLOC_012834
TCONS_00025610 mRNA downstream 122263 27318589 ~ 27336157 (+) True XLOC_012836
TCONS_00025611 mRNA downstream 141668 27337994 ~ 27358871 (+) True XLOC_012837
TCONS_00025612 mRNA downstream 243354 27439680 ~ 27570030 (+) False XLOC_012838
TCONS_00025594 other upstream 448283 26747811 ~ 26747927 (+) True XLOC_012828
TCONS_00025591 other upstream 765025 26429665 ~ 26431185 (+) True XLOC_012824
TCONS_00025586 other upstream 769573 26425139 ~ 26426637 (+) True XLOC_012823
TCONS_00025570 other upstream 2455489 24737379 ~ 24740721 (+) False XLOC_012812
TCONS_00025571 other upstream 2456036 24737959 ~ 24740174 (+) False XLOC_012812
TCONS_00025621 other downstream 540398 27736724 ~ 27736840 (+) True XLOC_012841
TCONS_00025628 other downstream 1107565 28303891 ~ 28304317 (+) True XLOC_012845
TCONS_00025637 other downstream 1978767 29175093 ~ 29175208 (+) True XLOC_012849
TCONS_00025648 other downstream 2933473 30129799 ~ 30130552 (+) False XLOC_012854
TCONS_00025649 other downstream 2933473 30129799 ~ 30131831 (+) True XLOC_012854