RNA id: TCONS_00031241


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031241
length 66
RNA type TR_J_gene
GC content 0.32
exon number 1
gene id XLOC_015667
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 36107846 ~ 36107911 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGAATGATGGAAGTGGATATGGAAAGCTGATCTTTGGTTCTGGCaccaaattatatattaataaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193555

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00031209 lncRNA upstream 13527 36093561 ~ 36094319 (+) True XLOC_015636
TCONS_00033607 lncRNA upstream 29208 36072953 ~ 36078638 (+) True XLOC_015631
TCONS_00033606 lncRNA upstream 493548 35612555 ~ 35614298 (+) False XLOC_015623
TCONS_00031186 lncRNA upstream 501949 35603637 ~ 35605897 (+) False XLOC_015622
TCONS_00033278 lncRNA upstream 526555 35579580 ~ 35581291 (+) True XLOC_015619
TCONS_00033608 lncRNA downstream 72332 36180243 ~ 36367124 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033609 lncRNA downstream 72332 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033610 lncRNA downstream 137011 36244922 ~ 36247469 (+) True XLOC_015703
TCONS_00033279 lncRNA downstream 271328 36379239 ~ 36425187 (+) False XLOC_015704
TCONS_00033280 lncRNA downstream 316943 36424854 ~ 36471110 (+) True XLOC_015704
TCONS_00031202 mRNA upstream 27939 36046126 ~ 36079907 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031203 mRNA upstream 31267 36046192 ~ 36076579 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031201 mRNA upstream 86238 36015049 ~ 36021608 (+) True XLOC_015630
TCONS_00031199 mRNA upstream 86600 36004381 ~ 36021246 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031200 mRNA upstream 93059 36007449 ~ 36014787 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031244 mRNA downstream 1091 36109002 ~ 36157911 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031253 mRNA downstream 4362 36112273 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031258 mRNA downstream 6283 36114194 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031275 mRNA downstream 13462 36121373 ~ 36157906 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031284 mRNA downstream 498108 36606019 ~ 36608762 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031240 other upstream 209 36107575 ~ 36107637 (+) True XLOC_015666
TCONS_00031239 other upstream 502 36107285 ~ 36107344 (+) True XLOC_015665
TCONS_00031238 other upstream 954 36106830 ~ 36106892 (+) True XLOC_015664
TCONS_00031237 other upstream 1713 36106071 ~ 36106133 (+) True XLOC_015663
TCONS_00031236 other upstream 1992 36105789 ~ 36105854 (+) True XLOC_015662
TCONS_00031242 other downstream 274 36108185 ~ 36108247 (+) True XLOC_015668
TCONS_00031243 other downstream 463 36108374 ~ 36108436 (+) True XLOC_015669
TCONS_00031245 other downstream 1098 36109009 ~ 36109071 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031246 other downstream 1681 36109592 ~ 36109657 (+) True XLOC_015670
TCONS_00031247 other downstream 2247 36110158 ~ 36110223 (+) True XLOC_015671