RNA id: TCONS_00031209



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00031209
length 273
lncRNA type retained_intron
GC content 0.40
exon number 2
gene id XLOC_015636
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 36092953 ~ 36094319 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGTATTTTCTTCACAGTAAAATGTTCTGCTGTGCAAGTGTTAGTTCATTTGTCTGCTTTGGAATGATGTTTGAGCAAAAAAATGAGCTGTGATGGAAAACTCATCCCTTAATACACTGTTTCTTACAGATGAAGTGTAGAAATGTCCCAGGATCTCAAATCAGTATCGAGCTGGGACTCTAAGGTTTTATGTCTGGGAATGAAGCACTGTGGTCATCCGGTTCGAACTTCAAGCTTTTAATGGGATCTGGAACCAAGTTAAATGTGCAGCAAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000161694

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033607 lncRNA upstream 14923 36072953 ~ 36078638 (+) True XLOC_015631
TCONS_00033606 lncRNA upstream 479263 35612555 ~ 35614298 (+) False XLOC_015623
TCONS_00031186 lncRNA upstream 487664 35603637 ~ 35605897 (+) False XLOC_015622
TCONS_00033278 lncRNA upstream 512270 35579580 ~ 35581291 (+) True XLOC_015619
TCONS_00033605 lncRNA upstream 512616 35517875 ~ 35580945 (+) False XLOC_015619
TCONS_00033608 lncRNA downstream 85924 36180243 ~ 36367124 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033609 lncRNA downstream 85924 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033610 lncRNA downstream 150603 36244922 ~ 36247469 (+) True XLOC_015703
TCONS_00033279 lncRNA downstream 284920 36379239 ~ 36425187 (+) False XLOC_015704
TCONS_00033280 lncRNA downstream 330535 36424854 ~ 36471110 (+) True XLOC_015704
TCONS_00031202 mRNA upstream 13654 36046126 ~ 36079907 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031203 mRNA upstream 16982 36046192 ~ 36076579 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031201 mRNA upstream 71953 36015049 ~ 36021608 (+) True XLOC_015630
TCONS_00031199 mRNA upstream 72315 36004381 ~ 36021246 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031200 mRNA upstream 78774 36007449 ~ 36014787 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031229 mRNA downstream 8990 36103309 ~ 36155743 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031244 mRNA downstream 14683 36109002 ~ 36157911 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031253 mRNA downstream 17954 36112273 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031258 mRNA downstream 19875 36114194 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031275 mRNA downstream 27054 36121373 ~ 36157906 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031207 other upstream 2881 36089660 ~ 36090680 (+) True XLOC_015635
TCONS_00031206 other upstream 4844 36088658 ~ 36088717 (+) True XLOC_015634
TCONS_00031205 other upstream 5082 36088431 ~ 36088479 (+) True XLOC_015633
TCONS_00031204 other upstream 5782 36087769 ~ 36087779 (+) True XLOC_015632
TCONS_00031197 other upstream 94985 35991137 ~ 35998576 (+) False XLOC_015629
TCONS_00031210 other downstream 675 36094994 ~ 36095056 (+) True XLOC_015637
TCONS_00031211 other downstream 1087 36095406 ~ 36095465 (+) True XLOC_015638
TCONS_00031212 other downstream 1586 36095905 ~ 36095967 (+) True XLOC_015639
TCONS_00031213 other downstream 2048 36096367 ~ 36096429 (+) True XLOC_015640
TCONS_00031214 other downstream 2409 36096728 ~ 36096787 (+) True XLOC_015641

Expression Profile


//