RNA id: TCONS_00031205


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031205
length 49
RNA type TR_J_gene
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_015633
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 36088431 ~ 36088479 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CCGACCCACTAACTTTCGGAGCTCCCATCCGTCTCACGGTCAATCCAAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000171447

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033607 lncRNA upstream 9793 36072953 ~ 36078638 (+) True XLOC_015631
TCONS_00033606 lncRNA upstream 474133 35612555 ~ 35614298 (+) False XLOC_015623
TCONS_00031186 lncRNA upstream 482534 35603637 ~ 35605897 (+) False XLOC_015622
TCONS_00033278 lncRNA upstream 507140 35579580 ~ 35581291 (+) True XLOC_015619
TCONS_00033605 lncRNA upstream 507486 35517875 ~ 35580945 (+) False XLOC_015619
TCONS_00031209 lncRNA downstream 5082 36093561 ~ 36094319 (+) True XLOC_015636
TCONS_00033608 lncRNA downstream 91764 36180243 ~ 36367124 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033609 lncRNA downstream 91764 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033610 lncRNA downstream 156443 36244922 ~ 36247469 (+) True XLOC_015703
TCONS_00033279 lncRNA downstream 290760 36379239 ~ 36425187 (+) False XLOC_015704
TCONS_00031202 mRNA upstream 8524 36046126 ~ 36079907 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031203 mRNA upstream 11852 36046192 ~ 36076579 (+) False XLOC_015631
TCONS_00031201 mRNA upstream 66823 36015049 ~ 36021608 (+) True XLOC_015630
TCONS_00031199 mRNA upstream 67185 36004381 ~ 36021246 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031200 mRNA upstream 73644 36007449 ~ 36014787 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031229 mRNA downstream 14830 36103309 ~ 36155743 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031244 mRNA downstream 20523 36109002 ~ 36157911 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031253 mRNA downstream 23794 36112273 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031258 mRNA downstream 25715 36114194 ~ 36157913 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031275 mRNA downstream 32894 36121373 ~ 36157906 (+) False XLOC_015656
TCONS_00031204 other upstream 652 36087769 ~ 36087779 (+) True XLOC_015632
TCONS_00031197 other upstream 89855 35991137 ~ 35998576 (+) False XLOC_015629
TCONS_00031194 other upstream 256986 35831329 ~ 35831445 (+) True XLOC_015626
TCONS_00031167 other upstream 2155430 33927219 ~ 33933001 (+) True XLOC_015607
TCONS_00031163 other upstream 2185976 33902325 ~ 33902455 (+) True XLOC_015606
TCONS_00031206 other downstream 179 36088658 ~ 36088717 (+) True XLOC_015634
TCONS_00031207 other downstream 1181 36089660 ~ 36090680 (+) True XLOC_015635
TCONS_00031208 other downstream 4474 36092953 ~ 36094319 (+) False XLOC_015636
TCONS_00031210 other downstream 6515 36094994 ~ 36095056 (+) True XLOC_015637
TCONS_00031211 other downstream 6927 36095406 ~ 36095465 (+) True XLOC_015638