RNA id: TCONS_00036649


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00036649
length 5578
lncRNA type inter_gene
GC content 0.35
exon number 1
gene id XLOC_017557
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 40488004 ~ 40518327 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00034883 lncRNA upstream 21098 40464744 ~ 40466906 (+) True XLOC_017556
TCONS_00034882 lncRNA upstream 25766 40457659 ~ 40462238 (+) False XLOC_017556
TCONS_00036648 lncRNA upstream 239858 40240162 ~ 40248146 (+) True XLOC_017555
TCONS_00034879 lncRNA upstream 285331 40173379 ~ 40202673 (+) True XLOC_017554
TCONS_00034874 lncRNA upstream 566898 39920443 ~ 39921106 (+) True XLOC_017553
TCONS_00036650 lncRNA downstream 376314 40869895 ~ 40888021 (+) True XLOC_017560
TCONS_00036651 lncRNA downstream 433550 40927131 ~ 40944911 (+) True XLOC_017561
TCONS_00036652 lncRNA downstream 754878 41248459 ~ 41253693 (+) False XLOC_017563
TCONS_00036653 lncRNA downstream 754899 41248480 ~ 41361446 (+) False XLOC_017563
TCONS_00034890 lncRNA downstream 754899 41248480 ~ 41450118 (+) False XLOC_017563
TCONS_00034881 mRNA upstream 15485 40457599 ~ 40472519 (+) False XLOC_017556
TCONS_00034880 mRNA upstream 234322 40237441 ~ 40253682 (+) False XLOC_017555
TCONS_00034877 mRNA upstream 256625 40150646 ~ 40231379 (+) False XLOC_017554
TCONS_00034878 mRNA upstream 279985 40150677 ~ 40208019 (+) False XLOC_017554
TCONS_00034876 mRNA upstream 309045 40150646 ~ 40178959 (+) False XLOC_017554
TCONS_00034885 mRNA downstream 246383 40739964 ~ 40740707 (+) False XLOC_017558
TCONS_00034886 mRNA downstream 246383 40739964 ~ 40774857 (+) True XLOC_017558
TCONS_00034887 mRNA downstream 273064 40766645 ~ 40840993 (+) False XLOC_017559
TCONS_00034888 mRNA downstream 275684 40769265 ~ 40840865 (+) True XLOC_017559
TCONS_00034889 mRNA downstream 527473 41021054 ~ 41242638 (+) True XLOC_017562
TCONS_00034862 other upstream 1155912 39331969 ~ 39332092 (+) True XLOC_017544
TCONS_00034855 other upstream 1441824 38910241 ~ 39046180 (+) True XLOC_017540
TCONS_00034852 other upstream 1712917 38774972 ~ 38775087 (+) True XLOC_017538
TCONS_00034845 other upstream 1839114 38620666 ~ 38648890 (+) False XLOC_017535
TCONS_00034905 other downstream 2139404 42632985 ~ 42633105 (+) True XLOC_017575
TCONS_00034912 other downstream 2512723 43006304 ~ 43009613 (+) True XLOC_017581
TCONS_00034930 other downstream 3646164 44139745 ~ 44139861 (+) True XLOC_017600
TCONS_00034931 other downstream 3705117 44198698 ~ 44198815 (+) True XLOC_017601
TCONS_00034940 other downstream 4441458 44935039 ~ 44935155 (+) True XLOC_017608

Expression Profile

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