RNA id: TCONS_00034940



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00034940
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_017608
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 44935039 ~ 44935155 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ggcGCTTTTCAAAGCACTTAAGAACACCTTACAGTATACCGcccactgaagttaagcagggctgagcttggtcaatacctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgccg

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121254

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00034939 lncRNA upstream 320658 44609771 ~ 44614381 (+) True XLOC_017607
TCONS_00036678 lncRNA upstream 367783 44563932 ~ 44567256 (+) False XLOC_017606
TCONS_00036677 lncRNA upstream 368577 44563932 ~ 44566462 (+) False XLOC_017606
TCONS_00036679 lncRNA upstream 368577 44563939 ~ 44566462 (+) True XLOC_017606
TCONS_00034935 lncRNA upstream 397252 44516163 ~ 44537787 (+) True XLOC_017605
TCONS_00036680 lncRNA downstream 489236 45424391 ~ 45425819 (+) True XLOC_017609
TCONS_00036681 lncRNA downstream 731003 45666158 ~ 45669350 (+) True XLOC_017611
TCONS_00036414 lncRNA downstream 901743 45836898 ~ 45841825 (+) True XLOC_017613
TCONS_00036682 lncRNA downstream 959013 45894168 ~ 45896540 (+) True XLOC_017616
TCONS_00036683 lncRNA downstream 964993 45900148 ~ 45902157 (+) True XLOC_017617
TCONS_00034938 mRNA upstream 142482 44582451 ~ 44792557 (+) False XLOC_017607
TCONS_00034936 mRNA upstream 296135 44582318 ~ 44638904 (+) False XLOC_017607
TCONS_00034937 mRNA upstream 330348 44582321 ~ 44604691 (+) False XLOC_017607
TCONS_00034934 mRNA upstream 426648 44498056 ~ 44508391 (+) True XLOC_017604
TCONS_00034933 mRNA upstream 587417 44311448 ~ 44347622 (+) False XLOC_017603
TCONS_00034941 mRNA downstream 684921 45620076 ~ 45622385 (+) True XLOC_017610
TCONS_00034942 mRNA downstream 806411 45741566 ~ 45752016 (+) True XLOC_017612
TCONS_00034943 mRNA downstream 917999 45853154 ~ 45857670 (+) True XLOC_017614
TCONS_00034944 mRNA downstream 958018 45893173 ~ 45899149 (+) True XLOC_017615
TCONS_00034948 mRNA downstream 1105511 46040666 ~ 46043405 (+) False XLOC_017620
TCONS_00034931 other upstream 736224 44198698 ~ 44198815 (+) True XLOC_017601
TCONS_00034930 other upstream 795178 44139745 ~ 44139861 (+) True XLOC_017600
TCONS_00034912 other upstream 1925426 43006304 ~ 43009613 (+) True XLOC_017581
TCONS_00034905 other upstream 2301934 42632985 ~ 42633105 (+) True XLOC_017575
TCONS_00034862 other upstream 5602947 39331969 ~ 39332092 (+) True XLOC_017544
TCONS_00034947 other downstream 1104436 46039591 ~ 46041367 (+) False XLOC_017620
TCONS_00034979 other downstream 1507425 46442580 ~ 46494784 (+) False XLOC_017646
TCONS_00034980 other downstream 1521889 46457044 ~ 46494690 (+) False XLOC_017646
TCONS_00034982 other downstream 1573390 46508545 ~ 46513858 (+) False XLOC_017646
TCONS_00035004 other downstream 2169555 47104710 ~ 47104873 (+) True XLOC_017657