RNA id: TCONS_00042786



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00042786
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_021542
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 15353133 ~ 15353249 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TCTATGAGTTGCagttctctgcaactctcacatggtcacccactgaagctaagcagggctgtgcccggtcagtacctgaatggaaggccacatgggaaaactaggttgctgctggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176964

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044797 lncRNA upstream 1118126 14233725 ~ 14235007 (+) True XLOC_021536
TCONS_00042774 lncRNA upstream 1210898 14097508 ~ 14142235 (+) False XLOC_021534
TCONS_00044796 lncRNA upstream 1411855 13928339 ~ 13941278 (+) False XLOC_021533
TCONS_00044795 lncRNA upstream 1502641 13844754 ~ 13850492 (+) True XLOC_021532
TCONS_00044794 lncRNA upstream 1505429 13844557 ~ 13847704 (+) False XLOC_021532
TCONS_00044660 lncRNA downstream 124935 15478184 ~ 15478737 (+) True XLOC_021543
TCONS_00044661 lncRNA downstream 125496 15478745 ~ 15483453 (+) False XLOC_021544
TCONS_00042787 lncRNA downstream 125832 15479081 ~ 15483879 (+) False XLOC_021544
TCONS_00042788 lncRNA downstream 128691 15481940 ~ 15483879 (+) True XLOC_021544
TCONS_00044662 lncRNA downstream 396503 15749752 ~ 15756516 (+) True XLOC_021545
TCONS_00042785 mRNA upstream 549332 14771979 ~ 14803801 (+) True XLOC_021541
TCONS_00042784 mRNA upstream 621241 14696043 ~ 14731892 (+) True XLOC_021540
TCONS_00042781 mRNA upstream 621652 14590483 ~ 14731481 (+) False XLOC_021540
TCONS_00042780 mRNA upstream 621652 14590483 ~ 14731481 (+) False XLOC_021540
TCONS_00042783 mRNA upstream 621652 14673922 ~ 14731481 (+) False XLOC_021540
TCONS_00042791 mRNA downstream 1077310 16430559 ~ 16525698 (+) False XLOC_021555
TCONS_00042793 mRNA downstream 1116281 16469530 ~ 16525698 (+) True XLOC_021555
TCONS_00042795 mRNA downstream 1267552 16620801 ~ 16642181 (+) False XLOC_021557
TCONS_00042794 mRNA downstream 1267552 16620801 ~ 16642181 (+) False XLOC_021557
TCONS_00042797 mRNA downstream 1280702 16633951 ~ 16642181 (+) False XLOC_021557
TCONS_00042779 other upstream 882562 14468003 ~ 14470571 (+) True XLOC_021539
TCONS_00042770 other upstream 1748813 13604218 ~ 13604320 (+) True XLOC_021527
TCONS_00042766 other upstream 1910411 13442608 ~ 13442722 (+) True XLOC_021525
TCONS_00042749 other upstream 3134758 12213967 ~ 12218375 (+) True XLOC_021513
TCONS_00042745 other upstream 3202466 12134839 ~ 12150667 (+) False XLOC_021511
TCONS_00042789 other downstream 396769 15750018 ~ 15751546 (+) True XLOC_021546
TCONS_00042790 other downstream 1003459 16356708 ~ 16357229 (+) True XLOC_021553
TCONS_00042792 other downstream 1091712 16444961 ~ 16446040 (+) True XLOC_021556
TCONS_00042812 other downstream 1505668 16858917 ~ 16859033 (+) True XLOC_021565
TCONS_00042818 other downstream 1545076 16898325 ~ 16901006 (+) False XLOC_021567