RNA id: TCONS_00052753


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00052753
length 23392
lncRNA type antisense_over
GC content 0.37
exon number 1
gene id XLOC_025629
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 41043023 ~ 41066414 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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TCONS_00050489 lncRNA downstream 1137062 42203476 ~ 42206974 (+) True XLOC_025639
TCONS_00052755 lncRNA downstream 1424045 42490459 ~ 42493371 (+) False XLOC_025640
TCONS_00052366 lncRNA downstream 1424087 42490501 ~ 42497766 (+) True XLOC_025640
TCONS_00050472 mRNA upstream 171657 40841897 ~ 40871366 (+) False XLOC_025626
TCONS_00050473 mRNA upstream 172502 40841984 ~ 40870521 (+) False XLOC_025626
TCONS_00050474 mRNA upstream 172502 40856095 ~ 40870521 (+) True XLOC_025626
TCONS_00050470 mRNA upstream 222411 40809011 ~ 40820612 (+) False XLOC_025625
TCONS_00050471 mRNA upstream 222848 40809892 ~ 40820175 (+) True XLOC_025625
TCONS_00050476 mRNA downstream 492268 41558682 ~ 41632059 (+) False XLOC_025631
TCONS_00050477 mRNA downstream 518884 41585298 ~ 41592928 (+) False XLOC_025631
TCONS_00050478 mRNA downstream 552611 41619025 ~ 41629374 (+) True XLOC_025631
TCONS_00050479 mRNA downstream 581223 41647637 ~ 41706238 (+) True XLOC_025632
TCONS_00050480 mRNA downstream 648552 41714966 ~ 41724932 (+) True XLOC_025633
TCONS_00050468 other upstream 248144 40792230 ~ 40794879 (+) True XLOC_025623
TCONS_00050467 other upstream 248183 40791746 ~ 40794840 (+) False XLOC_025623
TCONS_00050466 other upstream 249471 40791746 ~ 40793552 (+) False XLOC_025623
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TCONS_00050475 other downstream 433995 41500409 ~ 41500525 (+) True XLOC_025630
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TCONS_00050506 other downstream 2648285 43714699 ~ 43714783 (+) True XLOC_025655
TCONS_00050507 other downstream 2650413 43716827 ~ 43716915 (+) True XLOC_025656
TCONS_00050515 other downstream 3821623 44888037 ~ 44888153 (+) True XLOC_025662

Expression Profile

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