RNA id: TCONS_00068922



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00068922
length 600
lncRNA type sense_over
GC content 0.32
exon number 5
gene id XLOC_033969
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 41295974 ~ 41302860 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGAAACCTCTCCAAGACCTCCAACACTTATGACTGAAAATGAAGTCAGGAGTGTACAtctgtgttctgtgtggttgttTGCTAGCACTGCTACTTAAGAGTTCGGCCAATGGAGATAATGATTTCACCTTTTTAGCAGATATGGATGAGGACGAAAAAAAGAATTCGGATAATGATTTCACCTTTTTAGCACATGAGGATAAGGAAAAGAAGAATGAATGGCCTCAAAACAACACACAAGACATTACTCAAGAGTTACAAAACCCTGATGACAAGTTACTTTAAATGAAATAAAACAACTTATGCAAACtcaaacaaaacaacataaaatccTGATAAAAATAACATACCTCACTGTTTGTTGAATGATCTTTTTATCATTGCATCTGTAACAATACATCTGTGCCatactgaataataaaatattgagaTAAATACCTATAATTATAGTACAgtatatgaaatgtaaaaataaacagtGTTCACCAAGTTAACCAGCCTAAACAGTAATTCTGTGTATTATGACTatgtatgctttttaaaaatgctacTTTCATTatttggtggaaaaaaataattgaagtaaTTTGTCCACTGGCTA

Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00066506 lncRNA upstream 38388 41256507 ~ 41257714 (+) False XLOC_033968
TCONS_00068920 lncRNA upstream 40855 41252150 ~ 41255247 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066501 lncRNA upstream 51012 41241322 ~ 41245090 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066491 lncRNA upstream 145529 41146621 ~ 41150573 (+) False XLOC_033967
TCONS_00068587 lncRNA upstream 235470 40963386 ~ 41060632 (+) True XLOC_033965
TCONS_00066516 lncRNA downstream 19585 41322445 ~ 41324633 (+) False XLOC_033972
TCONS_00066527 lncRNA downstream 509651 41812511 ~ 41813343 (+) False XLOC_033979
TCONS_00068924 lncRNA downstream 1064579 42367439 ~ 42387340 (+) False XLOC_033983
TCONS_00068926 lncRNA downstream 1064597 42367457 ~ 42391959 (+) False XLOC_033983
TCONS_00068925 lncRNA downstream 1064597 42367457 ~ 42391959 (+) False XLOC_033983
TCONS_00066500 mRNA upstream 20205 41160225 ~ 41275897 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066499 mRNA upstream 20205 41160225 ~ 41275897 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066507 mRNA upstream 22396 41265618 ~ 41273706 (+) True XLOC_033968
TCONS_00066498 mRNA upstream 22528 41160225 ~ 41273574 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066497 mRNA upstream 22710 41160225 ~ 41273392 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066512 mRNA downstream 712 41303572 ~ 41312197 (+) True XLOC_033970
TCONS_00066513 mRNA downstream 10708 41313568 ~ 41318214 (+) False XLOC_033971
TCONS_00066514 mRNA downstream 12002 41314862 ~ 41318200 (+) True XLOC_033971
TCONS_00066515 mRNA downstream 19547 41322407 ~ 41330966 (+) False XLOC_033972
TCONS_00066517 mRNA downstream 19642 41322502 ~ 41326294 (+) True XLOC_033972
TCONS_00066505 other upstream 40855 41254621 ~ 41255247 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066503 other upstream 41665 41252693 ~ 41254437 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066502 other upstream 41707 41248170 ~ 41254395 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066504 other upstream 42073 41252697 ~ 41254029 (+) False XLOC_033968
TCONS_00066488 other upstream 182807 41112901 ~ 41113295 (+) True XLOC_033966
TCONS_00066520 other downstream 156793 41459653 ~ 41460435 (+) True XLOC_033975
TCONS_00066521 other downstream 279684 41582544 ~ 41582659 (+) True XLOC_033976
TCONS_00066524 other downstream 458401 41761261 ~ 41761379 (+) True XLOC_033978
TCONS_00066534 other downstream 1010914 42313774 ~ 42313888 (+) True XLOC_033982
TCONS_00066541 other downstream 1417545 42720405 ~ 42720519 (+) True XLOC_033987

Expression Profile


//