RNA id: TCONS_00073891


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073891
length 579
RNA type mRNA
GC content 0.54
exon number 5
gene id XLOC_037630
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 7410798 ~ 7444753 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CAAGGAGACAAGGAAGCTGAGGTGCCTCAGACATGGGACGATGATGGTACCCAGCCTGTGCGCTCGGGCTGGGAAGATGATGGTACTCAGGCTACCTGGGATGATGATGGTAGCCAGCCTGTGCGTGCCCCGGCCGCATACCCCACCTGggatgatgctgatgatgataAAGAAGATGATGGCTCTCAGCCTGTGCAGGCCAATGACAATGATCCTACCCAGGAGACCCAGGGGTGGGACGATGATGGGGCTCAGACTGCAGAAACAACAGCTGTTACAGAAGAGGCAGCAGCAGCTGAACCTGTAAGTGAGACTGTGCAGGAGAGCGCCGAGAGCCCAGAGAGCGTAGAGATGCCAGAATCCTTCCTGTTCAAAGTGAAAGCTATGCACGACTACAATGCCACCGACTCTGATGAGCTGGAGTTAAAGGCGGGGGACGTGGTGCTGGTAGTGAATTACGAAAATCCAGACGATCAgGATGACGGCTGGTTGATGGGAGTCAAAGAGGCTGATTGGATCCAGCAGAAAGATCTTGGGAAAAAAGGCGTGTTCCCTGAAAACTTCACCCAGAGGATGTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000144600

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073887 lncRNA downstream 51314 7357819 ~ 7359484 (-) True XLOC_037626
TCONS_00074961 lncRNA downstream 862002 6531549 ~ 6548796 (-) True XLOC_037614
TCONS_00073869 lncRNA downstream 908705 6414784 ~ 6502093 (-) True XLOC_037612
TCONS_00075290 lncRNA downstream 2364809 5044975 ~ 5045989 (-) True XLOC_037603
TCONS_00073852 lncRNA downstream 2366710 5043087 ~ 5044088 (-) False XLOC_037603
TCONS_00075291 lncRNA upstream 78125 7499260 ~ 7505531 (-) True XLOC_037631
TCONS_00075292 lncRNA upstream 520634 7941769 ~ 7942597 (-) True XLOC_037636
TCONS_00075293 lncRNA upstream 739206 8160341 ~ 8163995 (-) True XLOC_037637
TCONS_00075294 lncRNA upstream 863020 8284155 ~ 8286208 (-) True XLOC_037638
TCONS_00073916 lncRNA upstream 1587988 9009123 ~ 9024269 (-) False XLOC_037644
TCONS_00073890 mRNA downstream 16386 7394229 ~ 7394412 (-) True XLOC_037629
TCONS_00073889 mRNA downstream 20410 7390207 ~ 7390388 (-) True XLOC_037628
TCONS_00073888 mRNA downstream 32232 7371962 ~ 7378566 (-) True XLOC_037627
TCONS_00073884 mRNA downstream 123423 7275185 ~ 7287375 (-) False XLOC_037625
TCONS_00073894 mRNA upstream 2781 7423916 ~ 7444753 (-) True XLOC_037630
TCONS_00073895 mRNA upstream 94729 7515864 ~ 7539297 (-) False XLOC_037632
TCONS_00073896 mRNA upstream 94729 7515864 ~ 7539326 (-) False XLOC_037632
TCONS_00073898 mRNA upstream 200487 7621622 ~ 7640692 (-) False XLOC_037633
TCONS_00073899 mRNA upstream 213712 7634847 ~ 7655243 (-) False XLOC_037633
TCONS_00073875 other downstream 692997 6717677 ~ 6717801 (-) True XLOC_037618
TCONS_00073868 other downstream 1001527 6409157 ~ 6409271 (-) True XLOC_037613
TCONS_00073841 other downstream 2963694 4443918 ~ 4447104 (-) True XLOC_037598
TCONS_00073830 other downstream 3891087 3508318 ~ 3519711 (-) True XLOC_037592
TCONS_00073827 other downstream 3914219 3490831 ~ 3496579 (-) True XLOC_037591
TCONS_00073897 other upstream 101300 7522435 ~ 7539023 (-) True XLOC_037632
TCONS_00073901 other upstream 220625 7641760 ~ 7655301 (-) True XLOC_037633
TCONS_00073935 other upstream 2322424 9743559 ~ 9805319 (-) False XLOC_037657
TCONS_00073936 other upstream 2349200 9770335 ~ 9805319 (-) True XLOC_037657
TCONS_00073961 other upstream 3424783 10845918 ~ 10846549 (-) True XLOC_037667

Expression Profile

//