G2079600


Basic Information

Item Value
gene id G2079600
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 37627821 ~ 37631175 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2377861
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>TU2377863
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>TU2377864
TCCTTATCCACTGTTCttaacctctccctttctctccttatccactgttcttaacctctccctttctctccttatccactgttcttaacctctccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttctctccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttatcctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttATCCACTGTTCTTAACCTCTCCTTATCCACTAATCTtaacctctccctttcactccttATCCATTGTTCTtaacctctccctttcactccttatccactgttcttatcctcttcctttcactccttatccactgttcttatcctcttcctttcactccttatccactgttcttaacctcttcctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctcttcctttcactccttatccactgttcttatcctcttcctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttATCCACTGTTCTTAACCTCTCCTTATCCACTGTTCTTAAACTCTCCCTTTCATTCCTTATCCACTGTTCTtaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctcCCTTTCACTCCTTATCCACTGTTCTTATCCTCTTGCTTTCACTCCTTATCCACTGTTCTTATCCTCTTCCTTTCACTCCTTATCCACTGTTCTtaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccttatccactgttcttaaactctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaaactctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttctctccttatccactgttcttaacctctccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttatcctcttcctttcactccttatccactgttcttatcctcttcctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttatccactgttcttaacctctccctttcactccttATCCACTGTTCTTAACCTCTTCCTTTCACTCCTTATCCACTGTTTTTAACCTCTTCCTTTCACTCCTATCCACTGTTCTTAAACTCTCCCTTTCACTCCTTATCCACTGTTCTTATCCTCTTCCTTTCACTCCTTATCCACTGTTCTTAACCTCTCCTTATCCACTGTTCTTAATCTCTTCCTTTCACTCCTTATCCACTGTTTTTAACCTCTTCCTTTCACTCCTTATCCACTGTTCTtaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2377861 False 3161 lncRNA 0.43 2 37627821 37631175
TU2377863 False 1362 lncRNA 0.42 3 37627821 37629717
TU2377864 True 1625 lncRNA 0.42 4 37627821 37629717

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508012 LOC106581399 coding upstream 58948 37536529 ~ 37568873 (+)
trnat-agu-152 NA coding upstream 122019 37505729 ~ 37505802 (+)
trnat-agu-151 NA coding upstream 122187 37505561 ~ 37505634 (+)
mre11a mre11a coding upstream 270215 37318716 ~ 37357606 (+)
LOC110536894 NA coding upstream 352739 37031161 ~ 37276857 (+)
LOC110508017 NA coding downstream 421458 38052633 ~ 38060113 (+)
LOC110507217 NA coding downstream 838743 38469918 ~ 38474599 (+)
LOC110508002 LOC106581401 coding downstream 988375 38619550 ~ 38628170 (+)
LOC118944799 NA coding downstream 1408398 39039573 ~ 39039625 (+)
LOC110508028 neus coding downstream 2036814 39667989 ~ 39681560 (+)
G2079563 NA non-coding upstream 81731 37544545 ~ 37546090 (+)
G2079469 NA non-coding upstream 258085 37368859 ~ 37369736 (+)
G2079465 NA non-coding upstream 261914 37365664 ~ 37365907 (+)
G2079462 NA non-coding upstream 263437 37363277 ~ 37364384 (+)
G2079459 NA non-coding upstream 265963 37361581 ~ 37361858 (+)
G2079606 NA non-coding downstream 7711 37638886 ~ 37639112 (+)
G2079607 NA non-coding downstream 22624 37653799 ~ 37654022 (+)
G2079608 NA non-coding downstream 24353 37655528 ~ 37684763 (+)
G2079610 NA non-coding downstream 28412 37659587 ~ 37660543 (+)
G2079617 NA non-coding downstream 34638 37665813 ~ 37666183 (+)
G2079468 LOC106581367 other upstream 259685 37366739 ~ 37368136 (+)
G2079197 NA other upstream 346989 37279105 ~ 37280832 (+)
LOC110508005 LOC106613226 other upstream 1188467 36438225 ~ 36440709 (+)
G2078493 NA other upstream 1325779 36263506 ~ 36302664 (+)
G2079657 NA other downstream 184703 37815848 ~ 37819286 (+)
G2080014 NA other downstream 313757 37944932 ~ 37945151 (+)
G2081884 LOC106581433 other downstream 2196483 39827658 ~ 39837383 (+)
LOC110507223 LOC106613251 other downstream 2264492 39781189 ~ 39938079 (+)
G2081949 NA other downstream 2300699 39931874 ~ 39933835 (+)

Expression


Co-expression Network