G2079608


Basic Information

Item Value
gene id G2079608
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 37655528 ~ 37684763 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2377873
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>TU2377874
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>TU2377875
CTGGCACCAGTGACATGATTTAATTCCAAAGAAGAACCCGAAGTGAAGAAACAGAAACAGCTACAGGAAGAAAACGGTGAAGTAACCATGACAACTGAATTATAACCATAGACGctgttttctttctcttgttGTAATTTTGTGACAGTTATAATTTAAACGTGATTGACAGCGCATGCCAGAggagaaaaaacacacacaagtaTATAAAAATATGCCATTAGATTCATATCAACAATTGAGGACAGTGGGTGCACTATTTACAGAAAAAAACGGCAATATATACCAATATTTACATTACACACTTCTTTCACACACTGGCAGAAAGGCTACTGAAATGTACTAGGATGGCAGCATAACTTATTATGATGGTTAGAAGTAGTGTGAATGGTAAATTCTGAATGTCTTTGCCACAGTGATATCCTACTCAATTCTGTTACTTGATTAACATGAACGCTAGCATGCTtcatattctacaatgtagtgtCTATAAATGTAGTACGCAGTTACTGTGAAAACAGAGGTGGGTGGAGGGGACCATGGAAATATAATGTGACACACCGTCTACCCAATgtgacaacacaacaacatggacaGAATAAACAACAATTATTCCACACTTGGCTAAAGTACAGAACACTTTGCAAGTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACAGACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACAGACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACAGACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACAGACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACAGACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACAGACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACAGACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATGCCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACAGACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATACCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATGCCTCTACACAGAGACAGGCTGCTCCACTAACATAcctctacacagagacacagctagcAGCAGTTGAATATCCAAGGACCATCTGATTATATTGacatttttagtaatttagcagacgctcttatccagagcgacttacaggagcaattaagagttgtgccttgctcaagggcacattgtcAGATTTTTTGTCACCTAGTCGCcacggggattcgaaccagcaacctttcggttactcgcCCAaggctcttaaccgctaggctacctgtcgcgtCTGATAATCGGTTAGCCTCTTCATTGGCTCACAGTGGGGGAATTAGCCTAATGCTAATGCATTCGGTTGGAGTGGTTGAAGGTGACCCAGATAGTTTGCAGGGTAGTTCTCATGGCTTGGAGACATTAAACATTATCACCACTTGAGTCTGAACTTGAGGAcactggtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagagctctTGTAAATCACAATCTCTCAGAggcaaagaaagagagaaaaagacatcTATAAATTAAGCTGTAAAAAAATACAAAGCTAAAATCAAAAACATAAATACTGTACAAACACATCTCTACTACGACCTCTAAAATAAATGTTGTAAAACACACTTCACTGTAGTGGTGCGATGCTGTTTCAGTTCTTTTCAAATAGAACAAAcctttaaaataataaaaaacaaacacGAAAGTGATTAAGGGTGAGAAAGAGGTGTATGTATGAGTGAGTCATAGGCTGCGGCGAGACAAGCTGTGTTTTGTCAAACGAGtgaagaaagtgtgtgtgttcgtgtataGTTTTAGTAGGTACCCTTGCCATATATTGCACATTGGTTACTTTTATAATGTTACTCTTTAGTCTCCTTCACTCCCTTTtccatccctttctcctctcctccctaggaTAGAGTGTTCACATGGTGTGGGCCAAAAAGAGGAATCCAAAGATAGATGTTTGACCCCACTCCTCAGGCCCTTCTTCAAACTCCTTGTTCCATTGTTACTTCCATTAGTCCATCATTTGGCTTGTTGCAGAGTTCACAATCCTCTTCCCATCACTCGCCTTTCACCATGTctgcctcaatctctctctctctcttcttctccttcacctGATCGGTCTGTCCTCATCCACACTCTctatttccttctctctttctttcttgcttTCCCTCCATATCCTTCATCTAATCTCTTTTCTCCAGTCACTCACCCTTTcccaatctctgtctctctctctcttgttccctctctctcttgttccctctctctcttgttccctctctctcttgttccctctctctcttgttccctctccAAGTAAAGTCTGTAGAGTTTCATTATGACACGGAGTCCACAGACTGAGCAATACAAGTGGAGGGTGATTTACGCCGAAACACCAAGCACACACCACTCAGCGATTAACAACACACACAGTTGCATCGGCATAAActaaaacaacagaaacctggtTTAAAGTGAGCCTGTAGTTTTTCAGTCTGGGCTAACAACACCCATGCACAGAGAGATCAGAAGATTGAGCAAAGGACAAAAAAACTGGACCTAATAAAAAGGGGGAGGGGTTTAAAGAGGAGGGCGGGGTTTGTGTGCGGTTTCAGCTGAGGGTGGGGTTTAAAGGGGTCAGAGAACTCTCCAAGGCAGTACTGTATGTTGCTGGTGCTTAGGGGGTGGGCTTTATCAAATGGGGCCGGCTGATTGGCTCAGACCCTCCACAGCAGTAAGTGGTTGGTGCTGTCGTCCCGCCCCACTGTCTCACTGCTGCTATTGGTCAGCCGGAAGTCCTCATAGCCGTCGCCACCTGAGATCACCAGCTGATTGGTTTTGACGGGAAGGAGGGCGGAGGCTCGTCGGTGAGAGGAGTCCCGCCTCTGCAGACCCC
>TU2377876
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2377873 False 3305 lncRNA 0.45 2 37655528 37658864
TU2377874 False 1822 lncRNA 0.45 2 37655528 37684763
TU2377875 False 3289 lncRNA 0.45 2 37655528 37658864
TU2377876 True 3273 lncRNA 0.45 2 37655528 37658864

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508012 LOC106581399 coding upstream 86655 37536529 ~ 37568873 (+)
trnat-agu-152 NA coding upstream 149726 37505729 ~ 37505802 (+)
trnat-agu-151 NA coding upstream 149894 37505561 ~ 37505634 (+)
mre11a mre11a coding upstream 297922 37318716 ~ 37357606 (+)
LOC110536894 NA coding upstream 380446 37031161 ~ 37276857 (+)
LOC110508017 NA coding downstream 367870 38052633 ~ 38060113 (+)
LOC110507217 NA coding downstream 785155 38469918 ~ 38474599 (+)
LOC110508002 LOC106581401 coding downstream 934787 38619550 ~ 38628170 (+)
LOC118944799 NA coding downstream 1354810 39039573 ~ 39039625 (+)
LOC110508028 neus coding downstream 1983226 39667989 ~ 39681560 (+)
G2079607 NA non-coding upstream 1506 37653799 ~ 37654022 (+)
G2079606 NA non-coding upstream 16416 37638886 ~ 37639112 (+)
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G2079563 NA non-coding upstream 109438 37544545 ~ 37546090 (+)
G2079469 NA non-coding upstream 285792 37368859 ~ 37369736 (+)
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G2079660 NA non-coding downstream 62849 37747612 ~ 37893792 (+)
G2079657 NA non-coding downstream 131085 37815848 ~ 37819286 (+)
G2079661 NA non-coding downstream 137406 37822169 ~ 37824025 (+)
G2079468 LOC106581367 other upstream 287392 37366739 ~ 37368136 (+)
G2079197 NA other upstream 374696 37279105 ~ 37280832 (+)
LOC110508005 LOC106613226 other upstream 1216174 36438225 ~ 36440709 (+)
G2078493 NA other upstream 1353486 36263506 ~ 36302664 (+)
G2080014 NA other downstream 260169 37944932 ~ 37945151 (+)
G2081884 LOC106581433 other downstream 2142895 39827658 ~ 39837383 (+)
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G2081949 NA other downstream 2247111 39931874 ~ 39933835 (+)

Expression


Co-expression Network