srek1 (srek1,LOC106947217,LOC103154506,LOC106917056)


Basic Information

Item Value
gene id srek1
gene name srek1,LOC106947217,LOC103154506,LOC106917056
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053128.1
NCBI id CM020925.1
chromosome length 37416781
location 27076510 ~ 27091059 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

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ttttttttcttttttatttacacaatgCTTCAGTTTGAAGTGGTGAACTCGTGATAAAGTTTAGTACAAAAGCATTTCCAACACAACTGACAGTATATaaagaattttattttttatatccaTGTATCCATTATGTACGGTAAATACTGTAGAAACGATTCATAGTTTgctcctggggggggggggttaggcACTCAATATCTGTGTTAGGGACTGGATGTAAAGGTTTGGTAACACTGTTTTTGAAGAGCTtgggtgtatgtatgtacgttGTCCTTAGTTTGAAGATACATCTGATCTGTTTCCATAAACCACTCAATAAAGacacttttcattta

Function

symbol description
srek1 Predicted to enable RNA binding activity. Predicted to act upstream of or within RNA splicing. Predicted to be active in nucleoplasm. Orthologous to human SREK1 (splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1).

NR:

description
splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1 isoform X3

GO:

id name namespace
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function
GO:0000166 nucleotide binding molecular_function

KEGG:

id description
K13165 SREK1, SFRS12; splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_039780558.1 False 5338 mRNA 0.42 12 27076932 27091059

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network