XLOC_006409 (CABZ01033394.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_006409
gene name CABZ01033394.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 6032844 ~ 6038477 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00012426
tgcgcATGCTGGGAGTGAATGGGCGGAGATTGCATGTGAGTGAGAACGCTGCTGAGTgagtttttccttttctttcatttattctctttCTATACTTTATTGCAGTTTGTTCTTCCAACTATAGTTTTTTGGTGGTGAAAGATCTAGTCGGTATAAAGTTGATAGAGTTTAGAAACGCCGTTGACCGGCGTTTTTTTGCCGGTTGATTATGGCGGCGTTGACAAACAGCGCAGAGCAACTTTCACGCAGGCATGGCATTAAACTGGTACCTGCTGTGGAGTGCTCGGTTGAGGATTGCGCCCTGGCAGTCGGGGAAGCTGTCGGCTATGATAGTATAGTGTCTGCTTCCCGAATGAATGGTGCAGTTGTCATTTTTTTAGACTCCTTAGAAAAAGTGCACAGTGTAGTGCAAAGTGGAGTTGTTATCCGTGACACTTTTATCCCGGCAATGCCCCTAACACAACCTGCAAGAAAGATTATTCTGTCAAACGTTCCACCTTTTATTAAAGACGAACTGTTAATTACGGAGCTGTCTAGATATGGCAAAACAATGTCTCAAATGAAAAAGATACCACTTGGTTGCAAATCGGCTTTGTTAAAGCATGTGGTCTCTTTTAGGCGACAAATATATATGATTTTGAACAATGGAGTTGATGGTTTGAACGTGGCCTTTAAATTTCGGGTAGATGGCAGTGACTACGTTGTTTTTGCATCTTCAGATACAATGAGGTGTTATGAATGCGGGATGGAGGGGCATTTAAAGAGAAATTGTACCGCGCAGGCTGGTGATAAGAATGCCAGCGGTGTTGAGGTGGCACAGGAAAATACCGCTCCGGCTGGAGTGAATGAGCAGCAGCAGTCTGCGGATAATGCGAATGTTAGCATAGAGAATGAAAACACAAACGGTGCTGGCATGGAGCAGACTGACCATGTAAATGTTGAGGCAACCGTGCAGGGACAGTCCGTGGATAACGTGAATGATGATAGTACAGGAGAGGAAAGGGGAATGGATCATGATGCTGCTTCAGGGGACGTTGTAGGTACGGAAGAAAACGAtggaaaagttttgaaaacttgCAATGTCGCTGAGGCAGCAGGGTCTATTCTAAATGAGGAAGACATGAATGTTGATTTTGAAAATGATGAGacattgtttaaaacaccagTAATTAAGAGAAAGCGATCTAGTAAATTAAGAAAAGCAAACGAGGAAAGAACAGAGCAACAGGACAGTAGAAATGATGACTTTGATTGTAGCACTCAGGAGGATTCTGATGGGGAAGCTGTGAGCCCTACTAAATGGAGAAATGTGTATACATTTGAGAGAGTGagactttttttgcagaaaaCAAAGAATATGAAGAATGTTCAGGTGGTAGATTATTTTCCTGACCAAAGAGCATTTGTTGACTCAGTCGTTAGTTTAATGAGAAGTAAGGATGACAAGCAATTCACTGCACAGGAGGTGTATAGATTGAAGAAATTTGTTTCTAAAGTGAAGCTGGAACTAAGAAGCAAAGATGGTTTTGAGACtacttaaatctttttttctttatttatgttttttctttgtgtgtcttttcgaaataaataatttaatgagtGCAATAAGAATAGGAACTCTCAATCTGAATGGTGCTAGGTCTATTCAGAAAAGAGCATTGCTATTTGATTTAATAAGTCAAAAGAATATTGATGTAATGCTCGTTCAAGAAACACATAGTGATAGTTTGAATGAGATTGATTGGAGGAGAGAATGgcagggggaaatatatttttcacACCTAAACAATGTTCAAGGTGGAGTAGCCATTCTTTTTTCAAGGAATTTTTTGCCTGTTTCATGTGATATTAAACAAGAAATTCCTGGTCGGTTTTTAGCTATACAGGCAAAAtttgaaaaatttaattttgtCTTTTTGAATTTATATGCTCCTGTTATTGGCACTGAAAGAGTCCTTTTTCTTAACAATGCTTTTGGGTTTTTACAAAACTGTAGCTCAGATGATTATCTTTTTTTAGGGGGTGATTTTAACTGTACGGAAAATGATGTATTAGATAGAAACCACTTGGAACCTCATACCACTTCTGGGCGTACTATGCGTGAACTGATTGAAGCTCATAGCTTATGTGATGTATGGAGAGAGATGAATGGCTCTAATAAACAGTATACATGGACACATGTTAGAGATAACGTTCTTTCATTAGCCAGGCTTGATAggttttattgttttagttatcAGTTAAATATTATAAGAGATTGCTCAATTGCTCCAGTTGGTTTTTCGGATCATTCTATTGTTTTATGTACATGTCTAATAGCAAATATTAAAGTAATGAGTGCATATTGGCAATTTAATACTTCTTTGTTGGGTGATGCTAACTTTAAAGATGTGTTTTGTAAATTCTGGGAGAATTTTAAATTAAGAAagagttattttaaaaatctacGACAGTGGTGGGATTGTGGAAAagtagaaataaaaatattatgtcaACAATACGCATTCAATGTTTCTCGAGACATTGCACGTTCAATGAAAACATTTGAATctgaaattattaatttacagtatttGGTTGAAACCACTGGagataaaaaatgtattgatGCTCTTAAAAGAAAAAAGTCCGCTTTCTCAGACCTGCTGGCTATAAAAACACAAGGAGCTTTGGTTAGGTCTCGGTTTCAGGTGCTTACGCAAATGGATGCCCCATCTAAATTCTTTTTTGGTCTAGAAAGAAAAAATGGCCAAAGTCGTCTCATTCATTCTTTACGTGCTGAAAGTGGGCAGGTACTGATAGATCCTGCTGAGATAAGGAGAAGGGCTGTACAATTCTATGTGGATTTGTACAGGAGTGAATATAAAGAGGATGAAAATCTGTCTGCCAGTTTTTATGAAAACTTGCCTAACATATCACAGGAGTATAAGGAAAAGATTGAAAGGCCTCTCTCTGAACTTGAACTTTTAACAGCTTTAAAAGCCATGCAACCTGGTAAGGCTCCAGGTATTGATGGCCTCCCTATCGAGTTTTATAAAATCTTTTGGGACGTATTGGGAGAAGATTTTTTGGCTGTTCTTAATGAGAGTTTGACTGAGGGCTCACTCCCTCTGAGTTGTAGGAGGGCAGTGGTGACCCTGTTGCCTAAAAAAGGTGATTTACAGGAAATAAAGAACTGGCGACCAGTGAGTCTACTTTGTTCAGATTTTAAAATTCTCTCTAAAACATTGGCCAATAGATTAAAAAATGTGATAGGGCATATTATCCATCCTGACCAAACTTATTGTGTGCCTGGCAGGTCTATTATGGATAATATTAGTCTTGTTAGAGACATTCTAGATCTGTCTAGTTATTTTAATCTTGATTTGGGTTTAATTTCAATTGATCAGGAAAAAGCATTTGATCGTGTGGAGCATCAGTACCTTTGGAATACTCTTGAGGCTTTTGGTTTTGGATCAGGTTTTATTGGAATGATTAAAGTGTTGTATCAAGACATTGAAAGCGTATTGAAAATCAATGGTGGTTTGAGTGccccttttaaaataaatagaggTATAAGGCAAGGCTGTGCCCTGTCTGGAATGTTATATTCCTTGGCCATTGAGCCAATGTTAAGAAAGCTACGTTCTAGAATTGAAGGTTTTATGCTTGCCAATAAAAGTGTTCAACATCAATTATCAGCTTATGCGGATGATGTTATAGTTTTTGTTAATGGTCAAAAGGATGTAAATACTTTAGTGTCCATTATTAGTGAATTTGACAAACTTTCTGCAGCCAGAGTTAATTGGGGTAAAAGTGATGCTTTAATTAATGGCAAATGGAACAATGGTACTCCAATTTTACCTGGTGGGCTGATTTGGAAGAAGGGAGGTCTTAAATACCTGGGAGTATATCTTGGAGAGAGCACTATGCAACAAAAAAACTGGGATGgaataatagaaaaaatagaaggaaaattaaaaaaatggagATGGATTCACCCCCAGTTATCTTTTAGAGGTAGAGTACTAATTATTAACAATCTTATAGCTTCAACTTTGTGGCATAGGCTTTTTTGTACGGAACCTCCCTCAGGGTTGCTGTTATTTCTACAAGccaaattagttaattttttctgGGATAGAATGCACTGGGTGCCTCAAAGTGAACTTTATTTGCCTTTAGAAGAGGGTGGACAAGGACTGGTATCCCTAGTGAGCAGACATGCCACTTTTAGATTACAGTTTGTTCAGAGACTCTTAACAGGCCCGGTAGATTTGGTGTGGAGGAATGTGACTAAGGCTATTCTTCAAAGAGTTGACTGTCTCGGACTGGACATGACTTTGTTTTTTATGGATCATGGCAAATTGCACCTGAATGGATTACCTTTTTTCTATCAAAAACTGTTTAAGGCCTGGggttcatttaaaattaaaaggtCAGATTCTGCAGCCTCACTATTCTGGCTATTGGAAGAACCTTTGGTAAAGGGAGCTCGGCTGGACATTACAGATCAAGTACCAAATCTTTTTCAGAGACTGTGCATCACTAAGACTGTAAAGTTGGGACACCTAGTAAATATTGCGGGTGCTGATTTGAAAGACATAACTGCAGTGGCCTCTATGTTGGGTCAGAGGTCGCTCCGTTACACTGCAATGATTATGGAACTATGGAAGAAAAAATTAACAACTGAGGAACTTGTGCTTTTAAAAGACTTTGAGGAAGGACGCTTAACTCCAGATCTGAGAGATCCCTATCCCAAACACTGGATAACACCTGATTTGAAAGATAAGTTGGGCTTCTTATTGAATTTAGATGGGTTACAGTTTTTAGACTTTGGTGATTTGAATGGGAAAAAGATGTATAAATGTTTTGTCAAAATCATGTATAGAACAGTGTTATGTAATAAATCTGACAATGTCTGGAGGACAAAACTTAATTTGGGTGATGAAGTTAAACCGGTGTGGAGGGTATTATACAAACCACCATTGGTTAAAAAATCAGGTGACTTACAATGG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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000101795

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00012426 True 5634 mRNA 0.37 1 6032844 6038477

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_006408 actr2b coding downstream 54411 5946607 ~ 5978433 (-)
XLOC_006407 spred2b coding downstream 95810 5870644 ~ 5937034 (-)
XLOC_006406 NA coding downstream 300347 5730915 ~ 5732497 (-)
XLOC_006405 CR926469.1 coding downstream 408429 5579097 ~ 5624415 (-)
XLOC_006404 meis1b coding downstream 463282 5490551 ~ 5569562 (-)
XLOC_006410 dld coding upstream 37095 6075572 ~ 6081803 (-)
XLOC_006411 NA coding upstream 111744 6150221 ~ 6187744 (-)
XLOC_006412 CU984583.1 coding upstream 122104 6160581 ~ 6161564 (-)
XLOC_006413 si:zfos-1056e6.1 coding upstream 169888 6208365 ~ 6218248 (-)
XLOC_006414 tuba4l coding upstream 206742 6245219 ~ 6252514 (-)
XLOC_006338 rn7sk misc downstream 5206619 825904 ~ 826225 (-)
XLOC_006471 BX537274.2 misc upstream 4226264 10264741 ~ 10264905 (-)
XLOC_006403 NA non-coding downstream 545231 5480987 ~ 5487613 (-)
XLOC_006402 NA non-coding downstream 561255 5464154 ~ 5471589 (-)
XLOC_006401 NA non-coding downstream 636924 5390497 ~ 5395920 (-)
XLOC_006417 NA non-coding upstream 296887 6335364 ~ 6338658 (-)
XLOC_006419 NA non-coding upstream 1115845 7154322 ~ 7154837 (-)
XLOC_006421 NA non-coding upstream 1230735 7269212 ~ 7322676 (-)

Expression


Co-expression Network