XLOC_006422


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_006422
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 7305415 ~ 7316939 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00013747
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00013747 True 11393 lncRNA 0.39 2 7305415 7316939

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_006420 ninl coding downstream 71604 7171066 ~ 7233811 (-)
XLOC_006419 NA coding downstream 150578 7154322 ~ 7154837 (-)
XLOC_006418 CABZ01061524.1 coding downstream 274382 6960782 ~ 7031033 (-)
XLOC_006417 NA coding downstream 966757 6335364 ~ 6338658 (-)
XLOC_006416 mcph1 coding downstream 981404 6286594 ~ 6324011 (-)
XLOC_006423 si:dkey-45k15.1 coding upstream 52055 7368994 ~ 7432715 (-)
XLOC_006424 si:dkey-196h17.9 coding upstream 145776 7462715 ~ 7474324 (-)
XLOC_006425 pitx3 coding upstream 238781 7555720 ~ 7575216 (-)
XLOC_006426 NA coding upstream 430172 7747111 ~ 7749201 (-)
XLOC_006427 macroh2a2 coding upstream 436110 7753049 ~ 7767600 (-)
XLOC_006338 rn7sk misc downstream 6479190 825904 ~ 826225 (-)
XLOC_006471 BX537274.2 misc upstream 2947802 10264741 ~ 10264905 (-)
XLOC_006411 NA non-coding downstream 1117671 6150221 ~ 6187744 (-)
XLOC_006412 CU984583.1 non-coding downstream 1143851 6160581 ~ 6161564 (-)
XLOC_006406 NA non-coding downstream 1572918 5730915 ~ 5732497 (-)
XLOC_006428 NA non-coding upstream 851774 8168713 ~ 8230165 (-)
XLOC_006434 BX004962.1 non-coding upstream 1332772 8649711 ~ 8650051 (-)
XLOC_006435 BX004962.2 non-coding upstream 1338180 8655119 ~ 8655447 (-)
XLOC_006437 NA non-coding upstream 1443755 8760694 ~ 8776477 (-)

Expression


Co-expression Network