XLOC_008785 (CU655961.2)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_008785
gene name CU655961.2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 44133972 ~ 44143503 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00017443
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>TCONS_00017442
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>TCONS_00017444
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Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000105073

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00017443 False 3484 mRNA 0.39 2 44133972 44143503
TCONS_00017442 False 3613 mRNA 0.39 3 44133972 44143503
TCONS_00017444 True 3697 mRNA 0.38 2 44135726 44143503

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_008784 zgc:112998 coding upstream 35050 44093286 ~ 44098922 (+)
XLOC_008783 NA coding upstream 63569 44066151 ~ 44070403 (+)
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XLOC_008786 zgc:165514 coding downstream 40864 44184367 ~ 44189634 (+)
XLOC_008787 CU655961.3 coding downstream 47428 44190931 ~ 44193411 (+)
XLOC_008788 CU655961.4 coding downstream 57553 44201056 ~ 44205528 (+)
XLOC_008789 CU929391.1 coding downstream 63195 44206698 ~ 44226221 (+)
XLOC_008790 CU929391.3 coding downstream 85414 44228917 ~ 44230508 (+)
XLOC_008463 BX663520.1 misc upstream 22881690 21252191 ~ 21252282 (+)
XLOC_008779 CABZ01073033.1 non-coding upstream 304455 43829389 ~ 43829517 (+)
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XLOC_008773 NA non-coding upstream 1033573 43092822 ~ 43100399 (+)
XLOC_008795 NA non-coding downstream 342760 44486263 ~ 44488525 (+)
XLOC_008796 NA non-coding downstream 394645 44538148 ~ 44809977 (+)
XLOC_008797 CABZ01037139.1 non-coding downstream 717780 44861283 ~ 44861399 (+)
XLOC_008799 NA non-coding downstream 864911 45008414 ~ 45012176 (+)
XLOC_008800 NA non-coding downstream 1081434 45224937 ~ 45245369 (+)

Expression



Co-expression Network