RNA id: TCONS_00023427



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00023427
length 99
RNA type mRNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_011849
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 3841012 ~ 3986236 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATGGCTGGAGCTCAACCTGGCGTTCACGCGCTTCAACTCAAGCCGGTGCGCGTGTCCGAGAGCCTGAAGCGAGGCAGCAGATTCATGAAATGGGATGAG

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000160830

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024521 lncRNA downstream 73407 3904680 ~ 3912731 (-) False XLOC_011849
TCONS_00024520 lncRNA downstream 156312 3823109 ~ 3829826 (-) True XLOC_011848
TCONS_00024519 lncRNA downstream 935042 3020946 ~ 3051096 (-) True XLOC_011844
TCONS_00024809 lncRNA downstream 1549860 2430899 ~ 2436278 (-) True XLOC_011835
TCONS_00023403 lncRNA downstream 1564109 2401258 ~ 2422029 (-) True XLOC_011834
TCONS_00024522 lncRNA upstream 261655 4247891 ~ 4252248 (-) False XLOC_011851
TCONS_00024810 lncRNA upstream 264666 4250902 ~ 4252232 (-) False XLOC_011851
TCONS_00024811 lncRNA upstream 265343 4251579 ~ 4252232 (-) True XLOC_011851
TCONS_00024523 lncRNA upstream 1156149 5142385 ~ 5143041 (-) True XLOC_011854
TCONS_00024812 lncRNA upstream 1171135 5157371 ~ 5161030 (-) False XLOC_011855
TCONS_00023425 mRNA downstream 170445 3717384 ~ 3815693 (-) True XLOC_011847
TCONS_00023423 mRNA downstream 682333 3281440 ~ 3303805 (-) False XLOC_011846
TCONS_00023422 mRNA downstream 694769 3281440 ~ 3291369 (-) False XLOC_011846
TCONS_00023421 mRNA downstream 796068 3183276 ~ 3190070 (-) True XLOC_011845
TCONS_00023420 mRNA downstream 1040546 2902113 ~ 2945592 (-) True XLOC_011843
TCONS_00023428 mRNA upstream 241018 4227254 ~ 4231532 (-) True XLOC_011850
TCONS_00023429 mRNA upstream 253201 4239437 ~ 4245311 (-) False XLOC_011851
TCONS_00023430 mRNA upstream 253435 4239671 ~ 4245902 (-) False XLOC_011851
TCONS_00023431 mRNA upstream 253903 4240139 ~ 4252221 (-) False XLOC_011851
TCONS_00023432 mRNA upstream 310840 4297076 ~ 4318393 (-) False XLOC_011852
TCONS_00023424 other downstream 694682 3291340 ~ 3291456 (-) True XLOC_011846
TCONS_00023401 other downstream 1820368 2165656 ~ 2165770 (-) True XLOC_011832
TCONS_00023378 other downstream 3780828 205194 ~ 205310 (-) True XLOC_011808
TCONS_00023441 other upstream 1257104 5243340 ~ 5296561 (-) True XLOC_011855
TCONS_00023445 other upstream 1684682 5670918 ~ 5731699 (-) True XLOC_011860
TCONS_00023449 other upstream 1976739 5962975 ~ 5963065 (-) True XLOC_011866
TCONS_00023450 other upstream 1981013 5967249 ~ 5967346 (-) True XLOC_011867
TCONS_00023451 other upstream 2027319 6013555 ~ 6013671 (-) True XLOC_011868

Expression Profile


//