RNA id: TCONS_00000258


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00000258
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_000145
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 11380497 ~ 11380611 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tcctGCAGCTTGCTCTCTACCACCCTCACATGGTTgcacactgaagctaagcagggttgtgcctggtcagtacctggatggaagaccacatacGAAACCTGGGTTGCTGCAACAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184803

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00002813 lncRNA upstream 593180 10780928 ~ 10787317 (+) True XLOC_000143
TCONS_00003036 lncRNA upstream 699656 10645364 ~ 10680841 (+) True XLOC_000138
TCONS_00003035 lncRNA upstream 712469 10645264 ~ 10668028 (+) True XLOC_000137
TCONS_00000251 lncRNA upstream 716972 10662312 ~ 10663525 (+) True XLOC_000139
TCONS_00002812 lncRNA upstream 762567 10617524 ~ 10617930 (+) True XLOC_000136
TCONS_00002814 lncRNA downstream 552706 11933317 ~ 11933676 (+) True XLOC_000152
TCONS_00003037 lncRNA downstream 665881 12046492 ~ 12048509 (+) False XLOC_000155
TCONS_00000280 lncRNA downstream 791711 12172322 ~ 12181039 (+) False XLOC_000159
TCONS_00000284 lncRNA downstream 803886 12184497 ~ 12187708 (+) False XLOC_000159
TCONS_00000285 lncRNA downstream 805539 12186150 ~ 12187708 (+) True XLOC_000159
TCONS_00000257 mRNA upstream 262567 11107688 ~ 11117930 (+) True XLOC_000144
TCONS_00000255 mRNA upstream 603950 10771457 ~ 10776547 (+) False XLOC_000142
TCONS_00000256 mRNA upstream 603950 10771474 ~ 10776547 (+) True XLOC_000142
TCONS_00000254 mRNA upstream 641276 10720294 ~ 10739221 (+) True XLOC_000141
TCONS_00000252 mRNA upstream 683894 10683843 ~ 10696603 (+) False XLOC_000140
TCONS_00000260 mRNA downstream 279250 11659861 ~ 11668782 (+) True XLOC_000147
TCONS_00000261 mRNA downstream 309749 11690360 ~ 11707665 (+) False XLOC_000148
TCONS_00000262 mRNA downstream 311111 11691722 ~ 11707665 (+) False XLOC_000148
TCONS_00000264 mRNA downstream 330615 11711226 ~ 11733130 (+) False XLOC_000149
TCONS_00000265 mRNA downstream 330892 11711503 ~ 11719021 (+) True XLOC_000149
TCONS_00000253 other upstream 684169 10683995 ~ 10696328 (+) True XLOC_000140
TCONS_00000247 other upstream 1016646 10363720 ~ 10363851 (+) True XLOC_000133
TCONS_00000245 other upstream 1057225 10318077 ~ 10323272 (+) False XLOC_000132
TCONS_00000236 other upstream 1292972 10082478 ~ 10087525 (+) False XLOC_000127
TCONS_00000231 other upstream 1322440 10051784 ~ 10058057 (+) False XLOC_000126
TCONS_00000259 other downstream 88925 11469536 ~ 11469650 (+) True XLOC_000146
TCONS_00000263 other downstream 311137 11691748 ~ 11695168 (+) True XLOC_000148
TCONS_00000271 other downstream 634505 12015116 ~ 12033278 (+) False XLOC_000154
TCONS_00000272 other downstream 634545 12015156 ~ 12031300 (+) True XLOC_000154
TCONS_00000274 other downstream 665980 12046591 ~ 12047368 (+) True XLOC_000155