RNA id: TCONS_00032562


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00032562
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_016540
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 33569922 ~ 33570039 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agtcacagccatatcaccctgcagcccaagaccggttactcaccgAAGCTAAGCAGAACTGAGTCTGGTCAGAATCTGGAtggggagaccacatggaaaaactaggttgctgttagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119314

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00032556 lncRNA downstream 288187 33271841 ~ 33281735 (-) True XLOC_016537
TCONS_00033377 lncRNA downstream 345006 33220032 ~ 33224916 (-) True XLOC_016536
TCONS_00033877 lncRNA downstream 527763 33037373 ~ 33042159 (-) True XLOC_016535
TCONS_00032555 lncRNA downstream 528258 33037373 ~ 33041664 (-) False XLOC_016535
TCONS_00033876 lncRNA downstream 529902 33037373 ~ 33040020 (-) False XLOC_016535
TCONS_00033378 lncRNA upstream 212620 33782659 ~ 33785134 (-) False XLOC_016542
TCONS_00033878 lncRNA upstream 214687 33784726 ~ 33785190 (-) True XLOC_016542
TCONS_00033879 lncRNA upstream 273363 33843402 ~ 33926691 (-) False XLOC_016543
TCONS_00033379 lncRNA upstream 355135 33925174 ~ 33926779 (-) True XLOC_016543
TCONS_00033380 lncRNA upstream 536791 34106830 ~ 34107985 (-) True XLOC_016546
TCONS_00032559 mRNA downstream 114648 33434660 ~ 33455274 (-) True XLOC_016538
TCONS_00032558 mRNA downstream 114758 33423259 ~ 33455164 (-) False XLOC_016538
TCONS_00032553 mRNA downstream 743814 32812402 ~ 32826108 (-) False XLOC_016534
TCONS_00032554 mRNA downstream 744005 32812403 ~ 32825917 (-) True XLOC_016534
TCONS_00032552 mRNA downstream 800163 32761226 ~ 32769759 (-) True XLOC_016531
TCONS_00032563 mRNA upstream 111160 33681199 ~ 33687214 (-) True XLOC_016541
TCONS_00032564 mRNA upstream 399173 33969212 ~ 33993636 (-) False XLOC_016544
TCONS_00032565 mRNA upstream 399628 33969667 ~ 33993533 (-) True XLOC_016544
TCONS_00032566 mRNA upstream 438759 34008798 ~ 34072218 (-) False XLOC_016545
TCONS_00032567 mRNA upstream 438916 34008955 ~ 34072018 (-) False XLOC_016545
TCONS_00032557 other downstream 114723 33422411 ~ 33455199 (-) False XLOC_016538
TCONS_00032550 other downstream 883514 32682201 ~ 32686408 (-) True XLOC_016530
TCONS_00032544 other downstream 902657 32667132 ~ 32667265 (-) True XLOC_016529
TCONS_00032543 other downstream 903463 32666324 ~ 32666459 (-) True XLOC_016528
TCONS_00032537 other downstream 903707 32665124 ~ 32666215 (-) False XLOC_016527
TCONS_00032578 other upstream 1942032 35512071 ~ 35512876 (-) True XLOC_016551
TCONS_00032582 other upstream 2617141 36187180 ~ 36187673 (-) True XLOC_016556
TCONS_00032583 other upstream 2619547 36189586 ~ 36189919 (-) True XLOC_016557
TCONS_00032584 other upstream 2620768 36190807 ~ 36191279 (-) True XLOC_016558
TCONS_00032585 other upstream 2623307 36193346 ~ 36193896 (-) True XLOC_016559

Expression Profile

//