RNA id: TCONS_00034640


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00034640
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_017425
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 31387055 ~ 31387171 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

atccacagccatatcaccctgcagcccattACCGGTTATttactaaagctaagcagggctgagtctggtcTATACCTGGATGCGAGACCACATAgggaaactaggttgctgttgaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183500

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036395 lncRNA upstream 404485 30977338 ~ 30982570 (+) False XLOC_017420
TCONS_00036396 lncRNA upstream 404485 30977348 ~ 30982570 (+) False XLOC_017420
TCONS_00036397 lncRNA upstream 404485 30977505 ~ 30982570 (+) True XLOC_017420
TCONS_00036394 lncRNA upstream 409540 30976266 ~ 30977515 (+) False XLOC_017420
TCONS_00036393 lncRNA upstream 409559 30976266 ~ 30977496 (+) False XLOC_017420
TCONS_00034648 lncRNA downstream 844438 32231609 ~ 32240969 (+) True XLOC_017430
TCONS_00034649 lncRNA downstream 883736 32270907 ~ 32402360 (+) True XLOC_017431
TCONS_00034660 lncRNA downstream 1114592 32501763 ~ 32506237 (+) False XLOC_017436
TCONS_00034661 lncRNA downstream 1131038 32518209 ~ 32520467 (+) True XLOC_017436
TCONS_00036613 lncRNA downstream 1440249 32827420 ~ 32850103 (+) True XLOC_017440
TCONS_00034639 mRNA upstream 81552 31287356 ~ 31305503 (+) True XLOC_017424
TCONS_00034638 mRNA upstream 101075 31270761 ~ 31285980 (+) True XLOC_017423
TCONS_00034637 mRNA upstream 102165 31269778 ~ 31284890 (+) False XLOC_017423
TCONS_00034635 mRNA upstream 155933 31217495 ~ 31231122 (+) False XLOC_017422
TCONS_00034631 mRNA upstream 174499 31076488 ~ 31212556 (+) False XLOC_017421
TCONS_00034642 mRNA downstream 598290 31985461 ~ 31990453 (+) True XLOC_017427
TCONS_00034643 mRNA downstream 731388 32118559 ~ 32139062 (+) True XLOC_017428
TCONS_00034644 mRNA downstream 765184 32152355 ~ 32228851 (+) False XLOC_017429
TCONS_00034645 mRNA downstream 765231 32152402 ~ 32153807 (+) False XLOC_017429
TCONS_00034646 mRNA downstream 837234 32224405 ~ 32231157 (+) False XLOC_017429
TCONS_00034636 other upstream 164028 31217539 ~ 31223027 (+) True XLOC_017422
TCONS_00034628 other upstream 439510 30938162 ~ 30947545 (+) False XLOC_017419
TCONS_00034629 other upstream 439666 30939167 ~ 30947389 (+) False XLOC_017419
TCONS_00034627 other upstream 443961 30937934 ~ 30943094 (+) False XLOC_017419
TCONS_00034620 other upstream 807364 30579013 ~ 30579691 (+) False XLOC_017414
TCONS_00034641 other downstream 335081 31722252 ~ 31723497 (+) True XLOC_017426
TCONS_00034652 other downstream 1021716 32408887 ~ 32432467 (+) True XLOC_017432
TCONS_00034653 other downstream 1079715 32466886 ~ 32470454 (+) True XLOC_017433
TCONS_00034740 other downstream 3556200 34943371 ~ 34955260 (+) True XLOC_017481
TCONS_00034743 other downstream 3675635 35062806 ~ 35063981 (+) True XLOC_017485