RNA id: TCONS_00043030



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043030
length 82
RNA type miRNA
GC content 0.43
exon number 1
gene id XLOC_021680
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 24072029 ~ 24072110 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGTAGTCGTCTCCATCTTACGAGGCAGCATTGGATTTCATTACTTTTTCTAATACTGCCTGGTAATGATGATGATTGCTGCC

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115463

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044823 lncRNA upstream 790 24023455 ~ 24071239 (+) True XLOC_021679
TCONS_00044674 lncRNA upstream 153060 23918648 ~ 23918969 (+) True XLOC_021678
TCONS_00043026 lncRNA upstream 820776 23249989 ~ 23251253 (+) True XLOC_021675
TCONS_00044822 lncRNA upstream 1055728 22979078 ~ 23016301 (+) True XLOC_021672
TCONS_00043016 lncRNA upstream 1085657 22956677 ~ 22986372 (+) False XLOC_021672
TCONS_00043035 lncRNA downstream 15995 24088105 ~ 24091922 (+) True XLOC_021684
TCONS_00044824 lncRNA downstream 61671 24133781 ~ 24140410 (+) True XLOC_021686
TCONS_00044825 lncRNA downstream 411202 24483312 ~ 24492037 (+) False XLOC_021689
TCONS_00044826 lncRNA downstream 411403 24483513 ~ 24492037 (+) False XLOC_021689
TCONS_00043039 lncRNA downstream 413363 24485473 ~ 24485831 (+) True XLOC_021689
TCONS_00043029 mRNA upstream 76173 23918421 ~ 23995856 (+) True XLOC_021677
TCONS_00043028 mRNA upstream 157342 23658474 ~ 23914687 (+) True XLOC_021676
TCONS_00043027 mRNA upstream 159550 23485858 ~ 23912479 (+) False XLOC_021676
TCONS_00043024 mRNA upstream 819361 23232136 ~ 23252668 (+) False XLOC_021675
TCONS_00043025 mRNA upstream 819644 23232213 ~ 23252385 (+) False XLOC_021675
TCONS_00043034 mRNA downstream 13421 24085531 ~ 24113207 (+) False XLOC_021684
TCONS_00043036 mRNA downstream 52574 24124684 ~ 24131962 (+) True XLOC_021685
TCONS_00043038 mRNA downstream 200311 24272421 ~ 24291927 (+) True XLOC_021688
TCONS_00043040 mRNA downstream 429808 24501918 ~ 24508821 (+) False XLOC_021690
TCONS_00043043 mRNA downstream 517523 24589633 ~ 24598877 (+) True XLOC_021692
TCONS_00043017 other upstream 1022889 23020709 ~ 23049140 (+) False XLOC_021673
TCONS_00043003 other upstream 1480874 22591058 ~ 22591155 (+) True XLOC_021666
TCONS_00042986 other upstream 2448180 21623735 ~ 21623849 (+) True XLOC_021656
TCONS_00042958 other upstream 2957297 21067389 ~ 21114732 (+) False XLOC_021644
TCONS_00042937 other upstream 3600159 20471755 ~ 20471870 (+) True XLOC_021632
TCONS_00043031 other downstream 50 24072160 ~ 24072245 (+) True XLOC_021681
TCONS_00043032 other downstream 1705 24073815 ~ 24073896 (+) True XLOC_021682
TCONS_00043033 other downstream 1973 24074083 ~ 24074155 (+) True XLOC_021683
TCONS_00043037 other downstream 75945 24148055 ~ 24148771 (+) True XLOC_021687
TCONS_00043041 other downstream 429855 24501965 ~ 24507281 (+) True XLOC_021690