RNA id: TCONS_00051686


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051686
length 51
RNA type mRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_026515
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 33963247 ~ 34095221 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACAATGCTTTTGACTACTGGGGGAAAGGAACTATGGTCACCGTCTCGTCAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000151313

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00051677 lncRNA downstream 31560 33936453 ~ 33938821 (-) True XLOC_026512
TCONS_00051675 lncRNA downstream 34943 33922620 ~ 33935438 (-) False XLOC_026512
TCONS_00053065 lncRNA downstream 51186 33918566 ~ 33919195 (-) True XLOC_026511
TCONS_00051667 lncRNA downstream 279627 33681518 ~ 33690754 (-) True XLOC_026509
TCONS_00051659 lncRNA downstream 532649 33435754 ~ 33437732 (-) True XLOC_026506
TCONS_00053066 lncRNA upstream 169206 34139637 ~ 34141181 (-) True XLOC_026572
TCONS_00051762 lncRNA upstream 209376 34179807 ~ 34180432 (-) False XLOC_026573
TCONS_00051763 lncRNA upstream 209376 34179807 ~ 34180451 (-) True XLOC_026573
TCONS_00051771 lncRNA upstream 499723 34470154 ~ 34477363 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051773 lncRNA upstream 555511 34525942 ~ 34546406 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051685 mRNA downstream 191 33970138 ~ 33970190 (-) True XLOC_026516
TCONS_00051680 mRNA downstream 2614 33963247 ~ 33967767 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051681 mRNA downstream 2614 33965578 ~ 33967767 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051679 mRNA downstream 8792 33949246 ~ 33961589 (-) True XLOC_026514
TCONS_00051676 mRNA downstream 35181 33932379 ~ 33935200 (-) False XLOC_026512
TCONS_00051687 mRNA upstream 250 33970681 ~ 33970734 (-) True XLOC_026517
TCONS_00051688 mRNA upstream 517 33970948 ~ 33970998 (-) True XLOC_026518
TCONS_00051689 mRNA upstream 816 33971247 ~ 33971297 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051690 mRNA upstream 5495 33975926 ~ 33975939 (-) True XLOC_026519
TCONS_00051691 mRNA upstream 7528 33977959 ~ 33977969 (-) True XLOC_026520
TCONS_00051678 other downstream 21593 33948669 ~ 33948788 (-) True XLOC_026513
TCONS_00051656 other downstream 546053 33424192 ~ 33424328 (-) True XLOC_026505
TCONS_00051635 other downstream 996847 32972974 ~ 32973534 (-) True XLOC_026495
TCONS_00051585 other downstream 1782996 32186134 ~ 32187385 (-) False XLOC_026474
TCONS_00051529 other downstream 3169723 30800541 ~ 30800658 (-) True XLOC_026441
TCONS_00051702 other upstream 52734 34023165 ~ 34023613 (-) True XLOC_026529
TCONS_00051708 other upstream 64761 34035192 ~ 34035631 (-) True XLOC_026534
TCONS_00051712 other upstream 67050 34037481 ~ 34037881 (-) True XLOC_026535
TCONS_00051715 other upstream 76748 34047179 ~ 34047616 (-) True XLOC_026538
TCONS_00051716 other upstream 77774 34048205 ~ 34048653 (-) True XLOC_026539