RNA id: TCONS_00058978


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00058978
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_030164
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 30166456 ~ 30166572 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaccctgcagcccaagactggttgcTCACTGAAGCTAACAATGGCTGAAAttagtcagtacctggatgggagatcacatggtagagctaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000191882

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061719 lncRNA upstream 178025 29902153 ~ 29988431 (+) False XLOC_030159
TCONS_00061718 lncRNA upstream 178025 29902153 ~ 29988431 (+) False XLOC_030159
TCONS_00061717 lncRNA upstream 213540 29902153 ~ 29952916 (+) False XLOC_030159
TCONS_00061716 lncRNA upstream 213540 29902153 ~ 29952916 (+) False XLOC_030159
TCONS_00061720 lncRNA upstream 213540 29927543 ~ 29952916 (+) False XLOC_030159
TCONS_00061722 lncRNA downstream 556696 30723268 ~ 30724619 (+) False XLOC_030174
TCONS_00059000 lncRNA downstream 557411 30723983 ~ 30727648 (+) True XLOC_030174
TCONS_00061723 lncRNA downstream 613858 30780430 ~ 30916825 (+) False XLOC_030177
TCONS_00061724 lncRNA downstream 613858 30780430 ~ 30921998 (+) False XLOC_030177
TCONS_00061725 lncRNA downstream 613858 30780430 ~ 30974079 (+) False XLOC_030177
TCONS_00058977 mRNA upstream 75950 30089715 ~ 30090506 (+) True XLOC_030163
TCONS_00058973 mRNA upstream 269688 29851433 ~ 29896768 (+) True XLOC_030158
TCONS_00058971 mRNA upstream 317684 29831235 ~ 29848772 (+) False XLOC_030157
TCONS_00058969 mRNA upstream 340610 29820266 ~ 29825846 (+) True XLOC_030156
TCONS_00058968 mRNA upstream 343216 29820266 ~ 29823240 (+) False XLOC_030156
TCONS_00058979 mRNA downstream 12438 30179010 ~ 30209068 (+) True XLOC_030165
TCONS_00058980 mRNA downstream 217982 30384554 ~ 30391820 (+) True XLOC_030166
TCONS_00058981 mRNA downstream 225576 30392148 ~ 30411165 (+) False XLOC_030167
TCONS_00058983 mRNA downstream 351464 30518036 ~ 30533557 (+) False XLOC_030168
TCONS_00058984 mRNA downstream 351869 30518441 ~ 30529072 (+) False XLOC_030168
TCONS_00058976 other upstream 167609 29998762 ~ 29998847 (+) True XLOC_030162
TCONS_00058975 other upstream 175912 29990452 ~ 29990544 (+) True XLOC_030161
TCONS_00058974 other upstream 176235 29990147 ~ 29990221 (+) True XLOC_030160
TCONS_00058970 other upstream 318557 29831195 ~ 29847899 (+) False XLOC_030157
TCONS_00058972 other upstream 323339 29831405 ~ 29843117 (+) True XLOC_030157
TCONS_00058982 other downstream 225847 30392419 ~ 30409240 (+) True XLOC_030167
TCONS_00058990 other downstream 441266 30607838 ~ 30608538 (+) False XLOC_030170
TCONS_00058994 other downstream 502549 30669121 ~ 30670269 (+) True XLOC_030171
TCONS_00058998 other downstream 556557 30723129 ~ 30727648 (+) False XLOC_030174
TCONS_00058999 other downstream 557338 30723910 ~ 30726617 (+) False XLOC_030174