RNA id: TCONS_00059620


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00059620
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_030535
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 59755144 ~ 59755261 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

actggcagctagctctctgcaacaaTCACATGGTCGCCAACTGAAGCAAAGCAATGCTGCGCACGTttagtacctgaatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgctgtaAGTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117943

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061809 lncRNA upstream 68892 59606130 ~ 59686252 (+) False XLOC_030533
TCONS_00061808 lncRNA upstream 103435 59605988 ~ 59651709 (+) False XLOC_030533
TCONS_00061475 lncRNA upstream 119964 59634935 ~ 59635180 (+) True XLOC_030534
TCONS_00059612 lncRNA upstream 234193 59517959 ~ 59520951 (+) False XLOC_030531
TCONS_00061474 lncRNA upstream 265523 59489320 ~ 59489621 (+) True XLOC_030530
TCONS_00061476 lncRNA downstream 20212 59775473 ~ 59786832 (+) False XLOC_030533
TCONS_00061812 lncRNA downstream 287102 60042363 ~ 60078512 (+) False XLOC_030533
TCONS_00061811 lncRNA downstream 287102 60042363 ~ 60078512 (+) False XLOC_030533
TCONS_00061813 lncRNA downstream 287102 60042363 ~ 60093413 (+) False XLOC_030533
TCONS_00061814 lncRNA downstream 287102 60042363 ~ 60115888 (+) False XLOC_030533
TCONS_00059617 mRNA upstream 159547 59553732 ~ 59595597 (+) True XLOC_030532
TCONS_00059615 mRNA upstream 159554 59553636 ~ 59595590 (+) False XLOC_030532
TCONS_00059616 mRNA upstream 159554 59553679 ~ 59595590 (+) False XLOC_030532
TCONS_00059614 mRNA upstream 161607 59553636 ~ 59593537 (+) False XLOC_030532
TCONS_00059611 mRNA upstream 204201 59494079 ~ 59550943 (+) False XLOC_030531
TCONS_00059622 mRNA downstream 763350 60518611 ~ 60684971 (+) False XLOC_030537
TCONS_00059621 mRNA downstream 763350 60518611 ~ 60684971 (+) False XLOC_030537
TCONS_00059623 mRNA downstream 835535 60590796 ~ 60687619 (+) True XLOC_030537
TCONS_00059625 mRNA downstream 1092562 60847823 ~ 60873092 (+) True XLOC_030541
TCONS_00059626 mRNA downstream 1130842 60886103 ~ 60906496 (+) True XLOC_030542
TCONS_00059609 other upstream 275315 59436500 ~ 59479829 (+) False XLOC_030529
TCONS_00059581 other upstream 1372498 58372223 ~ 58382646 (+) True XLOC_030512
TCONS_00059579 other upstream 1542860 58212161 ~ 58212284 (+) True XLOC_030511
TCONS_00059578 other upstream 1717258 58037772 ~ 58037886 (+) True XLOC_030510
TCONS_00059556 other upstream 3449333 56290135 ~ 56305811 (+) True XLOC_030492
TCONS_00059624 other downstream 1020620 60775881 ~ 60775998 (+) True XLOC_030540
TCONS_00059631 other downstream 1504691 61259952 ~ 61260067 (+) True XLOC_030544
TCONS_00059636 other downstream 1596107 61351368 ~ 61351501 (+) False XLOC_030545
TCONS_00059637 other downstream 1596659 61351920 ~ 61351995 (+) False XLOC_030545
TCONS_00059638 other downstream 1597070 61352331 ~ 61352465 (+) False XLOC_030545