RNA id: TCONS_00059579



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00059579
length 124
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_030511
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 58212161 ~ 58212284 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ggccacagccatatcaccctgcatcCCAAGACTCACTAAAGGTTACTCACTGAGGCTAAGCAgtgctgagcctggtcagtacctggataggagactacataggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000164470

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00059573 lncRNA upstream 493428 57715810 ~ 57718733 (+) True XLOC_030505
TCONS_00061806 lncRNA upstream 727695 57480014 ~ 57484466 (+) False XLOC_030502
TCONS_00061805 lncRNA upstream 970608 57238718 ~ 57241553 (+) True XLOC_030498
TCONS_00061804 lncRNA upstream 1186661 57021588 ~ 57025500 (+) True XLOC_030496
TCONS_00061472 lncRNA upstream 1686468 56514990 ~ 56525693 (+) True XLOC_030494
TCONS_00059583 lncRNA downstream 203780 58416064 ~ 58417514 (+) False XLOC_030514
TCONS_00061473 lncRNA downstream 205010 58417294 ~ 58421500 (+) True XLOC_030514
TCONS_00059600 lncRNA downstream 903585 59115869 ~ 59202263 (+) True XLOC_030525
TCONS_00061807 lncRNA downstream 1176009 59388293 ~ 59389887 (+) True XLOC_030528
TCONS_00061474 lncRNA downstream 1277036 59489320 ~ 59489621 (+) True XLOC_030530
TCONS_00059577 mRNA upstream 285468 57924611 ~ 57926693 (+) True XLOC_030509
TCONS_00059576 mRNA upstream 414065 57773222 ~ 57798096 (+) True XLOC_030508
TCONS_00059575 mRNA upstream 448982 57743815 ~ 57763179 (+) True XLOC_030507
TCONS_00059574 mRNA upstream 473825 57726425 ~ 57738336 (+) True XLOC_030506
TCONS_00059572 mRNA upstream 493311 57715614 ~ 57718850 (+) False XLOC_030505
TCONS_00059580 mRNA downstream 159880 58372164 ~ 58382655 (+) False XLOC_030512
TCONS_00059582 mRNA downstream 185362 58397646 ~ 58412538 (+) True XLOC_030513
TCONS_00059584 mRNA downstream 209252 58421536 ~ 58450649 (+) True XLOC_030515
TCONS_00059585 mRNA downstream 243204 58455488 ~ 58481928 (+) False XLOC_030516
TCONS_00059586 mRNA downstream 243327 58455611 ~ 58483036 (+) True XLOC_030516
TCONS_00059578 other upstream 174275 58037772 ~ 58037886 (+) True XLOC_030510
TCONS_00059556 other upstream 1906350 56290135 ~ 56305811 (+) True XLOC_030492
TCONS_00059550 other upstream 1953995 56256188 ~ 56258166 (+) True XLOC_030489
TCONS_00059549 other upstream 1963426 56246736 ~ 56248735 (+) True XLOC_030488
TCONS_00059541 other upstream 2540579 55671466 ~ 55671582 (+) True XLOC_030479
TCONS_00059581 other downstream 159939 58372223 ~ 58382646 (+) True XLOC_030512
TCONS_00059609 other downstream 1224216 59436500 ~ 59479829 (+) False XLOC_030529
TCONS_00059620 other downstream 1542860 59755144 ~ 59755261 (+) True XLOC_030535
TCONS_00059624 other downstream 2563597 60775881 ~ 60775998 (+) True XLOC_030540
TCONS_00059631 other downstream 3047668 61259952 ~ 61260067 (+) True XLOC_030544