RNA id: TCONS_00059948



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00059948
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_030810
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 6929034 ~ 6929148 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ACTGGCAGCTAGCTccttgcaactctcacatggtcgcccactgaagctaagcgggGCTGCGCCCGATCAGTATCTggttgggagaccacatgggaaagctaggttgctgcggaaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182555

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00059947 lncRNA downstream 183546 6736276 ~ 6745488 (-) True XLOC_030809
TCONS_00061934 lncRNA downstream 417195 6511314 ~ 6511839 (-) True XLOC_030806
TCONS_00061510 lncRNA downstream 456280 6471025 ~ 6472754 (-) False XLOC_030804
TCONS_00061511 lncRNA upstream 447834 7376982 ~ 7377405 (-) True XLOC_030813
TCONS_00061512 lncRNA upstream 762727 7691875 ~ 7712224 (-) True XLOC_030815
TCONS_00061513 lncRNA upstream 795916 7725064 ~ 7725275 (-) True XLOC_030818
TCONS_00061514 lncRNA upstream 1164137 8093285 ~ 8096026 (-) True XLOC_030822
TCONS_00061935 lncRNA upstream 1388570 8317718 ~ 8325015 (-) True XLOC_030824
TCONS_00059944 mRNA downstream 183523 6726155 ~ 6745511 (-) False XLOC_030809
TCONS_00059945 mRNA downstream 183580 6726541 ~ 6745454 (-) False XLOC_030809
TCONS_00059946 mRNA downstream 183592 6726791 ~ 6745442 (-) False XLOC_030809
TCONS_00059942 mRNA downstream 361570 6516210 ~ 6567464 (-) True XLOC_030807
TCONS_00059941 mRNA downstream 367658 6515741 ~ 6561376 (-) False XLOC_030807
TCONS_00059950 mRNA upstream 269609 7198757 ~ 7199998 (-) True XLOC_030812
TCONS_00059952 mRNA upstream 558916 7488064 ~ 7513082 (-) False XLOC_030815
TCONS_00059953 mRNA upstream 558928 7488076 ~ 7712160 (-) False XLOC_030815
TCONS_00059955 mRNA upstream 792869 7722017 ~ 7834582 (-) False XLOC_030817
TCONS_00059956 mRNA upstream 794063 7723211 ~ 7829657 (-) False XLOC_030817
TCONS_00059943 other downstream 397852 6531067 ~ 6531182 (-) True XLOC_030808
TCONS_00059924 other downstream 1986322 4942598 ~ 4942712 (-) True XLOC_030789
TCONS_00059909 other downstream 2702414 4223515 ~ 4226620 (-) False XLOC_030776
TCONS_00059873 other downstream 4716246 2212672 ~ 2212788 (-) True XLOC_030748
TCONS_00059869 other downstream 4966625 1962282 ~ 1962409 (-) True XLOC_030744
TCONS_00059949 other upstream 219143 7148291 ~ 7148407 (-) True XLOC_030811
TCONS_00059951 other upstream 502277 7431425 ~ 7431523 (-) True XLOC_030814
TCONS_00059954 other upstream 703547 7632695 ~ 7632819 (-) True XLOC_030816
TCONS_00059964 other upstream 1043611 7972759 ~ 7972879 (-) True XLOC_030821
TCONS_00059969 other upstream 1452556 8381704 ~ 8388178 (-) True XLOC_030825