RNA id: TCONS_00059976


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00059976
length 125
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_030830
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 8635268 ~ 8635392 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCAAAGCACACAGCATCCTGAAGTACTCTACCTTCGCcacagttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggataggagaccactaggcaacactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119265

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061936 lncRNA downstream 218435 8409461 ~ 8416833 (-) True XLOC_030826
TCONS_00061935 lncRNA downstream 310253 8317718 ~ 8325015 (-) True XLOC_030824
TCONS_00061514 lncRNA downstream 539242 8093285 ~ 8096026 (-) True XLOC_030822
TCONS_00061513 lncRNA downstream 909993 7725064 ~ 7725275 (-) True XLOC_030818
TCONS_00061512 lncRNA downstream 923044 7691875 ~ 7712224 (-) True XLOC_030815
TCONS_00059977 lncRNA upstream 2412 8637804 ~ 8640000 (-) False XLOC_030831
TCONS_00061515 lncRNA upstream 2468 8637860 ~ 8639434 (-) True XLOC_030831
TCONS_00061516 lncRNA upstream 5286 8640678 ~ 8644183 (-) True XLOC_030832
TCONS_00059986 lncRNA upstream 324336 8959728 ~ 8963775 (-) True XLOC_030839
TCONS_00061517 lncRNA upstream 394848 9030240 ~ 9031751 (-) True XLOC_030840
TCONS_00059973 mRNA downstream 21051 8533929 ~ 8614217 (-) False XLOC_030828
TCONS_00059974 mRNA downstream 32331 8538736 ~ 8602937 (-) True XLOC_030828
TCONS_00059971 mRNA downstream 151731 8417184 ~ 8483537 (-) False XLOC_030827
TCONS_00059970 mRNA downstream 151731 8417184 ~ 8483537 (-) False XLOC_030827
TCONS_00059972 mRNA downstream 151811 8418240 ~ 8483457 (-) True XLOC_030827
TCONS_00059978 mRNA upstream 26022 8661414 ~ 8682590 (-) False XLOC_030833
TCONS_00059980 mRNA upstream 49260 8684652 ~ 8711157 (-) True XLOC_030834
TCONS_00059981 mRNA upstream 77406 8712798 ~ 8765428 (-) True XLOC_030835
TCONS_00059983 mRNA upstream 133677 8769069 ~ 8817841 (-) True XLOC_030837
TCONS_00059984 mRNA upstream 196907 8832299 ~ 8910703 (-) False XLOC_030838
TCONS_00059969 other downstream 247090 8381704 ~ 8388178 (-) True XLOC_030825
TCONS_00059964 other downstream 662389 7972759 ~ 7972879 (-) True XLOC_030821
TCONS_00059954 other downstream 1002449 7632695 ~ 7632819 (-) True XLOC_030816
TCONS_00059951 other downstream 1203745 7431425 ~ 7431523 (-) True XLOC_030814
TCONS_00059949 other downstream 1486861 7148291 ~ 7148407 (-) True XLOC_030811
TCONS_00059979 other upstream 43071 8678463 ~ 8682371 (-) True XLOC_030833
TCONS_00059982 other upstream 87536 8722928 ~ 8723043 (-) True XLOC_030836
TCONS_00059989 other upstream 531003 9166395 ~ 9170534 (-) True XLOC_030845
TCONS_00059990 other upstream 538146 9173538 ~ 9179436 (-) True XLOC_030846
TCONS_00059992 other upstream 544430 9179822 ~ 9186906 (-) False XLOC_030847