RNA id: TCONS_00067983


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00067983
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_034955
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 39234995 ~ 39235112 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatgtcaccctgcagcccaagactggttacttgctgaagctaagcagggctgagcctggtcagtgcctggatgggagaccacatgacaAAACTAAAAATCCAATGGCAc

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121013

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00067980 lncRNA downstream 254317 38978002 ~ 38980678 (-) True XLOC_034952
TCONS_00067979 lncRNA downstream 373516 38852270 ~ 38861479 (-) True XLOC_034951
TCONS_00067978 lncRNA downstream 399089 38830384 ~ 38835906 (-) False XLOC_034951
TCONS_00067968 lncRNA downstream 467086 38756326 ~ 38767909 (-) True XLOC_034948
TCONS_00067967 lncRNA downstream 520433 38703600 ~ 38714562 (-) True XLOC_034947
TCONS_00067985 lncRNA upstream 45306 39280418 ~ 39360325 (-) False XLOC_034956
TCONS_00068689 lncRNA upstream 100060 39335172 ~ 39336854 (-) False XLOC_034956
TCONS_00067989 lncRNA upstream 138427 39373539 ~ 39375761 (-) True XLOC_034957
TCONS_00067990 lncRNA upstream 202272 39437384 ~ 39441050 (-) True XLOC_034958
TCONS_00067997 lncRNA upstream 318646 39553758 ~ 39557294 (-) False XLOC_034961
TCONS_00067982 mRNA downstream 31196 39180876 ~ 39203799 (-) True XLOC_034954
TCONS_00067977 mRNA downstream 373254 38821438 ~ 38861741 (-) False XLOC_034951
TCONS_00067976 mRNA downstream 373254 38821438 ~ 38861741 (-) False XLOC_034951
TCONS_00067975 mRNA downstream 373254 38821438 ~ 38861741 (-) False XLOC_034951
TCONS_00067974 mRNA downstream 427176 38804370 ~ 38807819 (-) True XLOC_034950
TCONS_00067984 mRNA upstream 20669 39255781 ~ 39360325 (-) False XLOC_034956
TCONS_00067986 mRNA upstream 99758 39334870 ~ 39360325 (-) False XLOC_034956
TCONS_00067987 mRNA upstream 103713 39338825 ~ 39360325 (-) True XLOC_034956
TCONS_00067988 mRNA upstream 138122 39373234 ~ 39378903 (-) False XLOC_034957
TCONS_00067991 mRNA upstream 227938 39463050 ~ 39537292 (-) False XLOC_034959
TCONS_00067981 other downstream 98221 39136650 ~ 39136774 (-) True XLOC_034953
TCONS_00067973 other downstream 427170 38804123 ~ 38807825 (-) False XLOC_034950
TCONS_00067953 other downstream 590708 38642119 ~ 38644287 (-) False XLOC_034941
TCONS_00067949 other downstream 596706 38635643 ~ 38638289 (-) False XLOC_034940
TCONS_00067914 other downstream 1541043 37693838 ~ 37693952 (-) True XLOC_034923
TCONS_00067999 other upstream 480600 39715712 ~ 39716073 (-) True XLOC_034962
TCONS_00068010 other upstream 1303458 40538570 ~ 40551054 (-) False XLOC_034968
TCONS_00068023 other upstream 1713763 40948875 ~ 40949190 (-) True XLOC_034975
TCONS_00068036 other upstream 2179478 41414590 ~ 41416307 (-) True XLOC_034982
TCONS_00068043 other upstream 2257905 41493017 ~ 41493131 (-) True XLOC_034985