RNA id: TCONS_00068069


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00068069
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_034997
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 42153410 ~ 42153524 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCGGCAGCCAACTTTCTGCAACTTTCATGTGGTTGCCCACTGAAGTTATgtagggctgcgcctggtcagtacctggatgggagatcacatgggaaaactaagttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185393

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068691 lncRNA downstream 173398 41978388 ~ 41980012 (-) True XLOC_034995
TCONS_00068061 lncRNA downstream 272242 41875847 ~ 41881168 (-) True XLOC_034992
TCONS_00068056 lncRNA downstream 341055 41805086 ~ 41812355 (-) True XLOC_034990
TCONS_00068054 lncRNA downstream 376182 41764932 ~ 41777228 (-) False XLOC_034990
TCONS_00068053 lncRNA downstream 388306 41764304 ~ 41765104 (-) False XLOC_034990
TCONS_00068692 lncRNA upstream 200583 42354107 ~ 42355980 (-) True XLOC_034999
TCONS_00068693 lncRNA upstream 214221 42367745 ~ 42369924 (-) True XLOC_035000
TCONS_00068071 lncRNA upstream 233009 42386533 ~ 42388353 (-) True XLOC_035001
TCONS_00069278 lncRNA upstream 750843 42904367 ~ 42907198 (-) True XLOC_035003
TCONS_00069279 lncRNA upstream 758186 42911710 ~ 42920024 (-) True XLOC_035004
TCONS_00068067 mRNA downstream 185239 41951967 ~ 41968171 (-) True XLOC_034994
TCONS_00068065 mRNA downstream 188515 41951786 ~ 41964895 (-) False XLOC_034994
TCONS_00068066 mRNA downstream 188515 41951967 ~ 41964895 (-) False XLOC_034994
TCONS_00068064 mRNA downstream 188533 41947739 ~ 41964877 (-) False XLOC_034994
TCONS_00068063 mRNA downstream 236905 41903547 ~ 41916505 (-) True XLOC_034993
TCONS_00068082 mRNA upstream 1606625 43760149 ~ 43840680 (-) False XLOC_035010
TCONS_00068083 mRNA upstream 1607329 43760853 ~ 43787616 (-) False XLOC_035010
TCONS_00068084 mRNA upstream 1607947 43761471 ~ 43840418 (-) False XLOC_035010
TCONS_00068085 mRNA upstream 1607947 43761471 ~ 43857938 (-) False XLOC_035010
TCONS_00068087 mRNA upstream 2445789 44599313 ~ 44604540 (-) False XLOC_035012
TCONS_00068043 other downstream 660279 41493017 ~ 41493131 (-) True XLOC_034985
TCONS_00068036 other downstream 737103 41414590 ~ 41416307 (-) True XLOC_034982
TCONS_00068023 other downstream 1204220 40948875 ~ 40949190 (-) True XLOC_034975
TCONS_00068010 other downstream 1602356 40538570 ~ 40551054 (-) False XLOC_034968
TCONS_00067999 other downstream 2437337 39715712 ~ 39716073 (-) True XLOC_034962
TCONS_00068070 other upstream 137454 42290978 ~ 42291094 (-) True XLOC_034998
TCONS_00068072 other upstream 658531 42812055 ~ 42812169 (-) True XLOC_035002
TCONS_00068074 other upstream 1179104 43332628 ~ 43332742 (-) False XLOC_035005
TCONS_00068078 other upstream 1409600 43563124 ~ 43563240 (-) True XLOC_035008
TCONS_00068096 other upstream 2514479 44668003 ~ 44668117 (-) True XLOC_035015