RNA id: TCONS_00071471


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00071471
length 8556
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 9
gene id XLOC_036592
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 36057318 ~ 36125849 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000159581

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TCONS_00072495 lncRNA downstream 464810 35579388 ~ 35592508 (-) True XLOC_036588
TCONS_00072494 lncRNA downstream 465473 35579388 ~ 35591845 (-) False XLOC_036588
TCONS_00071464 lncRNA downstream 1594927 34461160 ~ 34462391 (-) False XLOC_036584
TCONS_00071483 lncRNA upstream 402384 36528233 ~ 36541856 (-) False XLOC_036601
TCONS_00071484 lncRNA upstream 407711 36533560 ~ 36541482 (-) True XLOC_036601
TCONS_00072497 lncRNA upstream 607067 36732916 ~ 36968730 (-) False XLOC_036604
TCONS_00072498 lncRNA upstream 668652 36794501 ~ 36798705 (-) True XLOC_036605
TCONS_00072499 lncRNA upstream 689269 36815118 ~ 36959996 (-) False XLOC_036604
TCONS_00071469 mRNA downstream 96331 35809081 ~ 35960987 (-) True XLOC_036591
TCONS_00071468 mRNA downstream 321177 35735234 ~ 35736141 (-) True XLOC_036589
TCONS_00071466 mRNA downstream 1289906 34766211 ~ 34767412 (-) True XLOC_036586
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TCONS_00071462 mRNA downstream 1629947 34382501 ~ 34427371 (-) True XLOC_036583
TCONS_00071472 mRNA upstream 2628 36128477 ~ 36140405 (-) True XLOC_036593
TCONS_00071473 mRNA upstream 157699 36283548 ~ 36287046 (-) True XLOC_036594
TCONS_00071474 mRNA upstream 195487 36321336 ~ 36327328 (-) True XLOC_036595
TCONS_00071475 mRNA upstream 237049 36362898 ~ 36370552 (-) False XLOC_036596
TCONS_00071476 mRNA upstream 242681 36368530 ~ 36370595 (-) True XLOC_036596
TCONS_00071467 other downstream 680961 35376243 ~ 35376357 (-) True XLOC_036587
TCONS_00071453 other downstream 2132807 33906377 ~ 33924511 (-) False XLOC_036577
TCONS_00071452 other downstream 2138741 33906377 ~ 33918577 (-) False XLOC_036577
TCONS_00071451 other downstream 2144337 33906377 ~ 33912981 (-) False XLOC_036577
TCONS_00071450 other downstream 2147251 33906377 ~ 33910067 (-) False XLOC_036577
TCONS_00071488 other upstream 689221 36815070 ~ 36815222 (-) False XLOC_036604
TCONS_00071489 other upstream 767784 36893633 ~ 36968730 (-) True XLOC_036604
TCONS_00071508 other upstream 1330666 37456515 ~ 37457198 (-) True XLOC_036613
TCONS_00071526 other upstream 2498306 38624155 ~ 38631651 (-) True XLOC_036624
TCONS_00071541 other upstream 3714448 39840297 ~ 39847614 (-) False XLOC_036638

Expression Profile

//

Homologous

species RNA id representative length rna type GC content exon number chromosome id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000053_06768909_06775364.mRNA True 3601 mRNA 0.42 4 CI01000053 6767972 ~ 6776006 (-)