RNA id: TCONS_00071790


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00071790
length 369
lncRNA type sense_over
GC content 0.39
exon number 4
gene id XLOC_036765
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 50134007 ~ 50135544 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACTTGTTTTTGCTGATATTCCAAATATGTAATTCCTGTTTTTTCGAACCTCTACAACCAGGAGCTACTAACTGTACAGATAGCGCAGATAATTCCACTCATCAATTTGAAACCAGTTGGAAAAGCGACAAATGCATCGAATGTTATTGCTCTGACGCTGGGATGGCATGCTGTGAAACGATGGCTACAGTGATAAACCAAACTGAAGGCTGCATTGTGGATTATGATTACAGCTCATGCACATTTAATGTGTACAAGCCGAATGAACCCAGCTTCGACTGTGCCTATAGTGTTGTTGCAAAATGAACGACTGAGAACATGTTCTTTCTGTACTTGATTTTGCAAGATTAAAGTCATTACGCATTGTTTA

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072538 lncRNA downstream 198494 49925575 ~ 49935513 (-) False XLOC_036763
TCONS_00072537 lncRNA downstream 262425 49864078 ~ 49871582 (-) False XLOC_036762
TCONS_00072540 lncRNA upstream 1979 50137475 ~ 50139983 (-) True XLOC_036766
TCONS_00071793 lncRNA upstream 122526 50258022 ~ 50259354 (-) True XLOC_036768
TCONS_00072541 lncRNA upstream 373265 50508761 ~ 50511887 (-) True XLOC_036772
TCONS_00071800 lncRNA upstream 754093 50889589 ~ 50898357 (-) True XLOC_036776
TCONS_00072089 lncRNA upstream 818162 50953658 ~ 50954244 (-) True XLOC_036777
TCONS_00071784 mRNA downstream 943 50066802 ~ 50133064 (-) False XLOC_036764
TCONS_00071785 mRNA downstream 1147 50079119 ~ 50132860 (-) True XLOC_036764
TCONS_00071782 mRNA downstream 198649 49885642 ~ 49935358 (-) False XLOC_036763
TCONS_00071783 mRNA downstream 198649 49928535 ~ 49935358 (-) True XLOC_036763
TCONS_00071781 mRNA downstream 225029 49885638 ~ 49908978 (-) False XLOC_036763
TCONS_00071791 mRNA upstream 7698 50143194 ~ 50147948 (-) True XLOC_036767
TCONS_00071792 mRNA upstream 121434 50256930 ~ 50259448 (-) False XLOC_036768
TCONS_00071794 mRNA upstream 149363 50284859 ~ 50287949 (-) True XLOC_036769
TCONS_00071795 mRNA upstream 187273 50322769 ~ 50346246 (-) True XLOC_036770
TCONS_00071796 mRNA upstream 327731 50463227 ~ 50482781 (-) True XLOC_036771
TCONS_00071775 other downstream 378108 49746232 ~ 49755899 (-) False XLOC_036760
TCONS_00071744 other downstream 961507 49169768 ~ 49172500 (-) False XLOC_036747
TCONS_00071743 other downstream 981532 49149904 ~ 49152475 (-) True XLOC_036746
TCONS_00071741 other downstream 1343420 48778961 ~ 48790587 (-) True XLOC_036742
TCONS_00071727 other downstream 1464880 48667290 ~ 48669127 (-) True XLOC_036736
TCONS_00071797 other upstream 382286 50517782 ~ 50517903 (-) True XLOC_036773
TCONS_00071804 other upstream 892343 51027839 ~ 51027953 (-) True XLOC_036779
TCONS_00071818 other upstream 1299000 51434496 ~ 51507179 (-) False XLOC_036786
TCONS_00071865 other upstream 3221283 53356779 ~ 53356896 (-) True XLOC_036812

Expression Profile

//